结论：村里能否主张收回军队农场早期利用的农村集体土地，需根据具体情况判断，包括土地使用性质、是否取得合法手续、使用期限以及是否存在法定收回情形等。以下从不同角度进行分析：
一、土地使用性质与合法手续
若军队农场开荒种地行为合法：
- 如果军队农场在开荒种地时，已经按照相关法律法规的规定，取得了农村集体土地的使用权，并且办理了相应的合法手续（如土地承包合同、土地使用权证等），那么其使用行为是合法的。
- 在这种情况下，村里不能随意主张收回土地，除非存在法定收回情形（如土地使用期限届满、军队农场违反土地使用规定等）。
若军队农场开荒种地行为违法：
- 如果军队农场在开荒种地时，未取得农村集体土地的使用权，或者未办理相应的合法手续，那么其使用行为可能是违法的。
- 在这种情况下，村里有权主张收回土地，但应依法进行，不能采取非法手段。
二、土地使用期限
- 如果军队农场与村里签订了土地承包合同，并约定了使用期限，那么在使用期限内，村里不能主张收回土地。
- 如果使用期限届满，且军队农场未继续取得土地使用权，那么村里可以主张收回土地。
三、法定收回情形
根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规的规定，存在以下情形之一的，农村集体经济组织可以收回土地使用权：
为乡（镇）村公共设施和公益事业建设，需要使用土地的：
- 如果村里因公共设施或公益事业建设需要使用该土地，且符合相关规划，那么可以依法收回土地。
不按照批准的用途使用土地的：
- 如果军队农场未按照批准的用途使用土地，如将农业用地转为非农业用地，那么村里可以依法收回土地。
因撤销、迁移等原因而停止使用土地的：
- 如果军队农场因撤销、迁移等原因而停止使用土地，那么村里可以依法收回土地。
其他法定收回情形：
- 如土地使用期限届满且未继续取得土地使用权、军队农场违反土地使用规定等。
四、建议与注意事项
核实土地使用手续：
- 村里应首先核实军队农场开荒种地时是否取得了合法的土地使用手续，以及使用期限是否届满。
依法进行收回：
- 如果村里决定收回土地，应依法进行，不得采取非法手段。可以与军队农场协商解决，或者通过法律途径解决争议。
考虑历史因素与实际情况：
- 在处理此类问题时，还应考虑历史因素与实际情况，如军队农场对土地的投入、使用情况等，以寻求公平合理的解决方案。
咨询专业律师：
- 由于此类问题涉及复杂的法律关系和事实认定，建议村里在处理前咨询专业律师的意见，以确保合法合规。
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