在被追尾且对方负主要责任的情况下，您可以按照以下详细步骤来处理，以确保您的权益得到妥善维护：
一、现场处理与确保安全
立即停车并设置警示：事故发生后，请立即停车，并开启车辆的危险报警闪光灯。在来车方向适当距离（城市道路50-100米，高速公路150米以外）设置三角警示标志，以防止二次事故的发生。
拍照记录现场：使用手机或相机从多个角度拍摄事故现场照片，包括车辆位置、碰撞部位、车牌号、道路标线和交通标志等。这些照片将作为后续责任认定和理赔的重要依据。
报警并确认责任：检查是否有人员受伤，如有需要，立即拨打120急救电话。同时，报警并告知交警事故发生的地点和伤亡情况。交警到场后，会进行现场勘查，并根据双方陈述和证据出具交通事故责任认定书。
二、后续理赔流程
通知保险公司：与对方交换驾驶证、行驶证信息，并让对方拨打其保险公司电话报案。同时，您也可以联系自己的保险公司，详细说明事故发生情况，了解理赔流程和所需材料。
定损与维修：对方保险公司的定损员将对车辆损坏情况进行评估。在此过程中，您要与定损员充分沟通，确保定损金额能够覆盖维修费用。之后，您可以选择保险公司指定的维修厂进行维修，或者自行选择有资质的正规维修厂。维修过程中，如发现额外维修需求，应及时与保险公司沟通并获得同意。
提交索赔材料：维修完成后，您需要准备理赔材料，如事故责任认定书、维修发票、维修清单等，并提交给对方保险公司进行审核。审核通过后，保险公司将按约定支付理赔款。
三、赔偿项目与标准
赔偿项目通常包括车辆维修费、车载物品损失费、替代交通工具费等财产损失，以及可能产生的医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、营养费等（如果事故中有人员受伤）。具体赔偿标准将依据相关司法解释和当地实际情况确定。
四、纠纷解决建议
协商解决：首先，您可以尝试与对方进行协商，就赔偿事宜达成一致意见。
申请调解：如果协商不成，您可以向公安机关交通管理部门申请调解。调解过程中，交警会协助双方进行沟通，并尝试达成和解。
提起诉讼：如果调解无果，或者对方拒绝履行赔偿责任，您可以向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
五、注意事项
保持冷静：在处理事故过程中，请保持冷静和理性，避免与对方发生冲突。
保存资料：妥善保存事故处理过程中的所有资料，如事故责任认定书、保险理赔记录、维修发票等，以备不时之需。
咨询专业人士：如果您对处理流程或赔偿标准有疑问，可以咨询律师或保险专业人士，以获取更专业的建议。
综上所述，被追尾且对方负主要责任时，您应确保安全、及时报警、配合交警调查、按流程进行保险理赔和车辆维修，并在必要时寻求法律帮助以维护自身权益。