耕地破坏的认定是一个涉及多个方面和程序的过程，以下将为您详细阐述：

一、耕地破坏程度认定范围

在办理涉嫌非法占用耕地违法犯罪案件时，以下情形通常会被认定为耕地破坏，并由省或者设区的市级自然资源主管部门出具耕地破坏程度行政认定意见：

1. 建筑物或构筑物建设：如建筑物或构筑物已经形成，地基施工基本完成，基坑已开挖或基础桩已基本完成施工，建筑物或构筑物基础和底层结构已基本完成。
2. 耕地硬化：对耕地使用水泥沥青进行硬化，改变了耕地的原有性质。
3. 挖砂、采石、采矿、取土：在耕地上进行挖砂、采石、采矿、取土等活动，明显造成土壤耕作层破坏。

二、耕地破坏程度认定部门

1. 省级自然资源厅：负责厅本级查处的非法占用农用地案件涉及的耕地破坏程度行政认定工作。
2. 设区的市自然资源主管部门：负责市本级和辖区内有关单位查处的非法占用农用地案件涉及的耕地破坏程度行政认定工作。

这些部门会成立耕地破坏程度认定委员会，由自然资源主管部门分管执法工作的领导担任负责人，成员包括执法、耕地保护、调查监测、规划、用途管制、测绘等业务部门的主要负责人。

三、耕地破坏程度认定程序

1. 申请：符合耕地破坏程度认定情形的，办案单位需要向省自然资源厅或设区的市级自然资源主管部门提出申请。
2. 实地踏勘：收到申请后，自然资源主管部门会组织认定委员会成员进行实地踏勘，了解耕地破坏的具体情况。
3. 专家论证：必要时，可以组织具有土地、测绘、农业等相关行业高级技术职称的专家进行论证，以确保认定的准确性和科学性。
4. 出具行政认定意见：根据实地踏勘和专家论证的结果，自然资源主管部门会出具相关行政认定意见。对于明显造成土壤耕作层破坏且不具有争议的，可以直接依据现场照片、录像等客观证据进行认定。

四、耕地破坏程度鉴定

如果对耕地破坏程度有争议、涉及关键专门性问题，或者办案单位及有关当事人不认可耕地破坏行政认定意见，那么需要对耕地破坏程度进行鉴定。这通常由办案单位委托从事耕地破坏程度鉴定相关业务的鉴定机构进行。鉴定机构会依据相关标准和程序进行鉴定，并出具鉴定报告。

五、相关国家标准

我国农业生态环境损害领域已经发布了首项国家标准《生态环境损害鉴定评估技术指南 生态系统 第1部分:农田生态系统》。该标准规定了农田生态系统损害鉴定评估的内容、工作程序、方法和技术要求，为耕地破坏程度的鉴定提供了更为科学和统一的依据。

概括起来，耕地破坏的认定是一个涉及多个部门和程序的过程，需要依据相关法律法规和标准进行。如果您对耕地破坏认定有进一步的疑问或需要具体的帮助，请随时咨询当地自然资源主管部门或相关法律机构。