在调查挪用公款的过程中，如果又发现了贪污3000元的情况，这通常意味着案件涉及了多个罪名，即挪用公款罪和贪污罪，需要分别根据两罪的法律规定来处理，但也可能因具体案情而数罪并罚或择一重罪处罚。以下是对这一问题的详细分析：
一、挪用公款罪与贪污罪的基本构成
挪用公款罪：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十四条的规定，国家工作人员利用职务上的便利，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的，是挪用公款罪。
贪污罪：根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条的规定，国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，是贪污罪。贪污数额较大或者有其他较重情节的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金。贪污3000元，若未达到贪污罪的数额较大标准（一般指三万元以上，但具体标准可能因地区和司法解释的调整而有所不同，且存在其他较重情节时也可能构成犯罪），但若存在其他较重情节，如贪污救灾、抢险等特定款物，则仍可能构成贪污罪。不过，若仅从数额上看且不存在其他情节，3000元可能不直接构成贪污罪的刑事立案标准，但此处的分析是基于假设其构成犯罪的情形进行的一般性阐述，实际需结合具体情节判断。若不构成贪污罪，则该行为可能作为挪用公款罪的加重情节或量刑考虑因素。
二、数罪并罚与择一重罪处罚的可能性
数罪并罚：如果挪用公款和贪污是两个独立的行为，且都构成了犯罪，那么根据刑法的规定，应当对两个罪名分别定罪量刑，然后按照数罪并罚的原则进行处罚。即，先分别确定两个罪名的刑罚，然后根据数罪并罚的规定，决定执行的刑罚。
择一重罪处罚：在某些情况下，如果挪用公款和贪污之间存在牵连关系，或者一个行为同时触犯了两个罪名（即想象竞合犯），那么可能会根据择一重罪处罚的原则进行处理。即，比较两个罪名的刑罚轻重，选择较重的罪名进行处罚。但在此案例中，挪用公款和贪污通常是两个独立的行为，因此更可能适用数罪并罚。不过，若贪污的3000元是挪用公款后的一种处理方式（如将挪用的公款据为己有），且该行为未单独构成贪污罪或数额未达贪污罪标准，则可能作为挪用公款罪的一个情节在量刑时予以考虑。
三、具体处理建议
详细调查：首先，需要对挪用公款和贪污的具体情况进行详细调查，包括挪用或贪污的数额、时间、方式、用途等，以及是否存在其他相关情节。
法律评估：根据调查结果，对挪用公款和贪污的行为进行法律评估，确定是否构成犯罪，以及构成哪个罪名。
制定辩护策略：如果案件进入刑事诉讼程序，作为辩护律师，我会根据案件的具体情况，制定合适的辩护策略，包括但不限于争取不构成犯罪、构成轻罪、减轻处罚或免除处罚等。
关注量刑情节：在量刑时，会关注各种量刑情节，如自首、立功、认罪态度、退赃情况等，以争取对当事人最有利的判决结果。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，因此上述分析仅供参考。在实际操作中，需要根据案件的具体情况和相关法律法规进行具体分析和处理。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。