在一个小时内出现两次未礼让行人的违法行为，将分别进行处罚，不因时间间隔短而合并处罚，每次违法行为均会面临罚款和记分的处罚。具体分析如下：

1. 处罚依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第四十七条的规定，机动车行经人行横道时，应当减速行驶；遇行人正在通过人行横道，应当停车让行。若机动车行经人行横道，未减速行驶或者遇行人正在通过人行横道未停车让行的，即构成未礼让行人的违法行为。

2. 处罚标准：对于未礼让行人的违法行为，通常的处罚标准是罚款并记分。具体罚款金额和记分数可能因地区而异，但一般罚款金额在20元至200元之间，记分通常为3分。例如，在某些地区，未礼让行人的罚款金额为50元，并记3分。

3. 多次违法行为的处理：若在一个小时内出现两次未礼让行人的违法行为，由于每次违法行为都是独立的，且均违反了道路交通安全法的相关规定，因此将分别进行处罚。这意味着，驾驶人将面临两次罚款和两次记分的处罚，而不是合并为一次处罚。

4. 特殊情况考虑：虽然一般情况下两次违法行为会分别处罚，但如果驾驶人能够证明两次违法行为之间存在某种特殊情况（如紧急避险等），且该特殊情况符合法律规定的免责条件，那么可能可以免除部分或全部处罚。然而，这种情况非常罕见，且需要驾驶人提供充分的证据来支持其主张。