军队与军转干部签订住房协议，在符合相关规定和程序的情况下，是正常的行为。以下从多个角度为你详细分析：
合法性角度
军队作为特殊的组织机构，在管理内部事务，包括军转干部的住房安排等方面，有相应的规章制度。只要签订的住房协议内容不违反国家法律法规的强制性规定，比如不涉及非法占用土地、不违反住房分配政策等，那么这种协议就是合法有效的。例如，军队根据自身的住房保障政策，为军转干部提供一定期限的住房使用权，并通过协议明确双方的权利义务，这是合法且合理的做法。
政策依据角度
国家和军队都有一系列关于军转干部安置的政策文件，其中可能涉及到住房方面的规定。这些政策旨在保障军转干部在转业后的基本生活需求，包括住房问题。军队依据这些政策与军转干部签订住房协议，是对政策的落实和执行。比如，某些政策可能规定军转干部在转业后的一定时间内可以居住在军队提供的住房中，军队与军转干部签订协议明确居住期限、租金等相关事项，就是基于政策要求进行的正常操作。
实际操作角度
在实际工作中，军队需要对军转干部进行妥善安置，住房是其中一个重要的方面。签订住房协议可以明确双方的权利和义务，避免后续可能出现的纠纷。例如，协议中可以规定军转干部在使用住房期间需要遵守的规章制度、房屋的维护责任等，同时也可以明确军队在住房提供方面的责任和义务，如保证住房的基本居住条件等。这样既有利于军队的管理，也有利于保障军转干部的合法权益。
特殊情况说明
当然，也存在一些特殊情况可能导致签订住房协议不正常。比如，如果军队在没有相关政策依据的情况下，随意与军转干部签订住房协议，或者协议内容存在显失公平、欺诈等情形，那么这种协议可能是无效的。另外，如果军队违反规定将住房分配给不符合条件的军转干部，并签订协议，这也是不正常的行为。
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