结论：公司账户被债主做财产保全后，员工能否通过仲裁拿到钱，取决于多种因素，包括公司财产状况、保全措施的具体情况、员工仲裁请求的合理性以及执行程序的进展等。以下从不同角度进行分析：
一、公司财产状况与保全措施的影响
公司财产充足：
- 如果公司除了被保全的账户外，还有其他足够的财产（如房产、车辆、存货等），且这些财产未被其他债权人申请保全或执行，那么员工在仲裁胜诉后，有可能通过执行程序获得赔偿。
- 仲裁机构或法院在裁决时，会考虑公司的实际支付能力，如果确认公司有支付能力，会裁决公司支付员工相应的款项。
公司财产不足：
- 如果公司财产不足以清偿所有债务，包括员工的仲裁请求，那么员工可能面临无法全额获得赔偿的风险。
- 在这种情况下，员工可能需要参与公司的破产清算程序，按照法定顺序分配公司剩余财产。
保全措施的具体情况：
- 财产保全的目的是确保将来判决能够得到有效执行。如果保全的财产价值足以覆盖员工的仲裁请求，且没有其他优先受偿的债权，员工在仲裁胜诉后较有可能获得赔偿。
- 如果保全的财产价值不足或存在其他优先受偿的债权（如银行贷款、税款等），员工获得赔偿的难度会增加。
二、员工仲裁请求的合理性
合法合理的请求：
- 如果员工的仲裁请求基于合法合理的劳动关系事实（如未支付工资、加班费、经济补偿等），且提供了充分的证据支持，仲裁机构或法院较有可能支持员工的请求。
- 在这种情况下，员工在仲裁胜诉后，有权要求公司支付相应的款项。
不合理或无法证明的请求：
- 如果员工的仲裁请求缺乏事实依据或法律依据，或者无法提供充分的证据支持，仲裁机构或法院可能不会支持员工的请求。
- 在这种情况下，员工无法通过仲裁获得赔偿。
三、执行程序的进展
及时申请执行：
- 员工在仲裁胜诉后，应及时向法院申请强制执行。如果执行程序进展顺利，且公司财产足够支付员工款项，员工较有可能获得赔偿。
- 如果员工未及时申请执行或执行程序因故中断，可能影响员工获得赔偿的时机和金额。
执行中的困难：
- 在执行过程中，可能遇到公司财产被转移、隐匿或无法变现等困难。这些情况可能导致员工无法及时获得赔偿或无法获得全额赔偿。
- 员工可以积极配合法院的执行工作，提供公司财产线索，协助法院查找和执行公司财产。
四、建议与措施
了解公司财产状况：
- 员工在申请仲裁前，应尽可能了解公司的财产状况，包括账户余额、房产、车辆等资产情况。这有助于员工评估仲裁胜诉后获得赔偿的可能性。
及时申请财产保全：
- 如果员工担心公司财产被其他债权人申请保全或执行，可以在仲裁过程中或仲裁前向法院申请财产保全。这有助于确保员工在仲裁胜诉后能够顺利获得赔偿。
积极配合仲裁和执行工作：
- 员工应积极配合仲裁机构和法院的工作，提供充分的证据支持自己的仲裁请求，并在仲裁胜诉后及时申请强制执行。同时，员工可以关注执行程序的进展，及时与法院沟通并提供公司财产线索。
寻求专业法律帮助：
- 如果员工在仲裁或执行过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理仲裁和执行等法律服务，帮助员工维护自己的合法权益。
总结来说，公司账户被债主做财产保全后，员工能否通过仲裁拿到钱取决于多种因素。员工应了解公司财产状况、及时申请财产保全、积极配合仲裁和执行工作，并在必要时寻求专业法律帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。