侵犯知识产权罪的案子中，赔偿标准的计算是一个综合考量多种因素的过程，主要依据《中华人民共和国民法典》《中华人民共和国著作权法》《中华人民共和国专利法》《中华人民共和国商标法》等相关法律法规。以下是对赔偿标准计算的详细归纳：
一、基本赔偿原则
填平原则：赔偿数额应足以弥补权利人因侵权所遭受的实际损失，这包括直接损失（如销售额下降、市场份额减少等）和间接损失（如商誉受损、客户流失等）。
法定赔偿与惩罚性赔偿相结合：在无法准确确定权利人实际损失或侵权人违法所得时，可适用法定赔偿；对于恶意侵权且情节严重的，可适用惩罚性赔偿，以加大对侵权行为的惩处力度。
二、具体赔偿方式及计算标准
按权利人实际损失计算：
- 赔偿金额通常包括权利人因侵权导致的直接经济损失，以及为制止侵权行为所支付的合理费用（如律师费、调查取证费、公证费等）。
- 计算公式可以简化为：赔偿金额 = 实际损失 + 合理开支。
按侵权人违法所得计算：
- 当权利人的实际损失难以确定时，可以根据侵权人因侵权所获得的利润来计算赔偿金额。
- 需要注意的是，这里应区分侵权产品的正常利润与因侵权额外获得的利润，确保赔偿金额的合理性。
法定赔偿：
- 当权利人的实际损失或侵权人的违法所得均无法确定时，法院会根据侵权行为的性质、持续时间、影响范围等因素，在法定范围内酌情确定赔偿数额。
- 不同知识产权类型（如著作权、专利权、商标权）的法定赔偿限额可能有所不同，但通常都在一个相对宽泛的范围内（如500元至500万元）。
惩罚性赔偿：
- 针对故意侵权且情节严重的行为，法院可以在上述赔偿数额的基础上附加一定倍数的惩罚性赔偿。
- 惩罚性赔偿的倍数通常为一倍以上五倍以下，具体倍数由法院根据侵权行为的严重程度、侵权人的主观恶意等因素综合确定。
三、特殊情形下的赔偿考量
举证妨碍规则：
- 如果权利人已经尽力举证，但侵权相关的账簿、资料等主要由侵权人掌握，且侵权人拒不提供或提供虚假资料，法院可以参考权利人的主张和提供的证据来确定赔偿数额。
合理开支单独计算：
- 权利人为制止侵权行为所支付的合理开支（如律师费、调查取证费等），如果已经实际支付且符合必要性标准，可以单独计算并纳入赔偿总额。
四、不同知识产权类型的赔偿标准差异
著作权侵权：
- 赔偿数额通常按照权利人因被侵权所受到的实际损失或者侵权人的违法所得确定。
- 如果难以计算，可以参照该权利使用费给予赔偿。
- 对于故意侵犯著作权且情节严重的，可以在上述赔偿数额的基础上附加惩罚性赔偿。
专利权侵权：
- 赔偿数额的确定方式与著作权侵权类似，但可能更侧重于专利许可使用费的倍数合理确定。
- 对于故意侵犯专利权且情节严重的，同样可以附加惩罚性赔偿。
商标权侵权：
- 赔偿数额的确定也遵循类似原则，但特别强调了对恶意侵犯商标专用权、情节严重的行为的惩处。
- 在这种情况下，法院可以在按照上述方法确定数额的基础上，判决一定倍数的惩罚性赔偿。
综上所述，侵犯知识产权罪的案子中赔偿标准的计算是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。如果您或您的企业面临此类问题，建议咨询专业律师以获取更具体、更准确的法律建议。