合伙设立有限公司时，应签订以下关键协议以确保各方权益得到妥善保护，公司运营顺畅：

1. 《合伙协议》/《股东协议》

   • 定义与作用：这是合伙人之间关于公司设立、运营、利润分配、风险承担等核心事项的基本准则，是规范内部关系的最重要文件。它详细规定了各方的权利与义务，为公司的稳定运营奠定基础。
   • 主要内容：
     • 基本信息：包括合伙企业名称、经营场地、经营范围、合伙人姓名、身份证号、联系方式、住址等。
     • 出资与股权：明确各合伙人的出资形式（货币、实物、知识产权等）、数额及比例，以及对应的股权结构。例如，甲出资50万元现金占股50%，乙以专利技术作价30万元占股30%。
     • 利润与亏损：详细规定利润分配原则、方式及亏损分担比例，确保公平合理。
     • 权利与义务：合伙人享有了解公司经营状况、参与决策等权利，同时负有遵守协议、忠实履职等义务。
     • 入伙退伙：设定新合伙人加入的条件、程序及合伙人退出的情形、财产结算方法，确保公司运营的连续性。
     • 事务执行与管理：规定企业日常事务的执行方式、管理架构及决策机制，如一般事项过半数同意，重大事项需三分之二以上通过。
     • 争议解决：约定争议发生时的解决途径，如协商、仲裁或诉讼，并指定具体机构或法院，以便及时有效解决纠纷。

2. 《公司章程》

   • 性质与作用：公司章程是公司的基本法律文件，规定了公司的经营范围、股东信息、组织结构、议事规则等核心内容，是公司设立和运营的基础。它具有法律效力，需在工商部门备案。
   • 与合伙协议的关系：若内容冲突，通常以章程为准（尤其在对外效力上）。因此，在制定公司章程时，应确保与合伙协议的内容相协调，避免产生法律纠纷。
   • 重点条款：包括公司经营范围、注册资本、股东信息；组织机构（股东会、董事会、监事会）职权；法定代表人任命、财务审计制度等。

3. 《出资协议》（可选但建议）

   • 定义与作用：若合伙协议中未详细规定出资细节，可单独签订出资协议，对股东的出资行为进行专门约定，确保出资义务得到严格履行，保障公司资本的稳定性和运营的持续性。
   • 主要内容：细化出资形式、金额、交付方式和期限，确保出资的准确性和及时性。同时，针对出资环节的违约情况制定具体责任条款，如逾期出资的利息支付等。

4. 《保密协议》

   • 定义与作用：保密协议旨在保护公司的商业秘密、技术秘密等敏感信息不被泄露，维护公司的竞争力和利益。在合伙设立有限公司的过程中，保密协议尤为重要，因为各方可能接触到公司的核心机密。
   • 主要内容：明确界定哪些信息属于保密范畴，如客户名单、财务数据、产品研发资料等；规定各方应采取的保密措施，限制接触人员范围，加密存储等；设定保密义务的有效期限；对违反保密协议的行为设定严格的法律责任，包括高额违约金和损害赔偿。

5. 《竞业禁止协议》（根据具体情况可选）

   • 定义与作用：竞业禁止协议用于防止合伙人在与公司存在竞争关系的业务中从事损害公司利益的行为。在合伙设立有限公司时，如果合伙人可能在未来从事与公司业务相竞争的活动，签订竞业禁止协议是必要的。
   • 主要内容：明确禁止合伙人从事的竞争业务领域和范围；设定竞业禁止的具体期限（通常离职后1-3年）和地域范围；因竞业禁止对合伙人就业选择有所限制，公司应给予一定的经济补偿；规定违反竞业禁止约定的违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。

额外建议：

• 书面化：所有协议必须采用书面形式，口头约定无效。这有助于在发生纠纷时提供有力的证据支持。
• 合规性：内容不得违反《公司法》等相关强制性规定。在制定协议时，应仔细研究相关法律法规，确保协议的合法性和有效性。
• 公证与备案：关键协议（如股权代持协议）建议公证，公司章程需提交工商局备案。这有助于增强协议的法律效力和公信力。
• 动态调整：根据公司发展阶段定期修订协议（如融资后调整股权结构）。随着公司的发展和变化，原有的协议可能不再适应新的情况，因此需要及时进行修订和调整。

总结与提醒：合伙设立有限公司时，签订上述协议是至关重要的。这些协议不仅明确了各方的权利和义务，还为公司未来的稳定运营提供了法律保障。如果你在协议制定过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。