在反不正当竞争与侵犯商业秘密竞合的情况下，选择哪个案由更好并没有一个绝对的答案，而是需要根据具体案件情况、证据收集、法律适用以及诉讼策略等多方面因素进行综合考量。以下是我从不同角度为你进行的分析：
一、法律适用与构成要件
反不正当竞争法：
- 该法主要规范市场经营者的竞争行为，防止不正当竞争行为损害其他经营者的合法权益。
- 若行为符合反不正当竞争法中关于商业秘密保护的相关规定（如窃取、使用、披露他人商业秘密等），且该行为对市场竞争秩序造成了损害，则可以选择反不正当竞争作为案由。
侵犯商业秘密罪（或民事侵权）：
- 侵犯商业秘密罪（刑事）或侵犯商业秘密权（民事）主要关注的是对商业秘密权利人的直接侵害。
- 若行为更侧重于对商业秘密本身的非法获取、使用或披露，且给权利人造成了直接经济损失，那么选择侵犯商业秘密作为案由可能更为贴切。
二、证据收集与证明难度
反不正当竞争：
- 在证明不正当竞争行为时，可能需要展示行为对市场竞争秩序的整体影响，这可能涉及更广泛的市场调查和数据分析。
- 但同时，反不正当竞争法也提供了一些相对宽泛的认定标准，如“混淆行为”、“虚假宣传”等，这些在证明上可能相对灵活。
侵犯商业秘密：
- 证明侵犯商业秘密通常需要更具体的证据，如商业秘密的存在、保密措施的合理性、行为人的非法获取或使用行为等。
- 这些证据的收集可能更为复杂和耗时，但一旦证明成功，对权利人的保护也更为直接和有力。
三、诉讼策略与赔偿请求
反不正当竞争：
- 选择反不正当竞争作为案由，可能更侧重于维护市场竞争秩序和公共利益。
- 在赔偿请求上，可能更侧重于请求行为人停止不正当竞争行为、消除影响、赔礼道歉等非财产性赔偿。
侵犯商业秘密：
- 选择侵犯商业秘密作为案由，则更侧重于保护权利人的商业秘密和直接经济损失。
- 在赔偿请求上，可以明确请求行为人赔偿因侵犯商业秘密而造成的直接经济损失，包括但不限于研发成本、市场机会损失等。同时，在刑事案件中，还可以追究行为人的刑事责任。
四、实际操作建议
- 全面评估案件情况：在决定选择哪个案由之前，应全面评估案件的具体情况，包括行为性质、证据收集、法律适用、诉讼策略等多方面因素。
- 咨询专业律师：虽然我在这里为你提供了一些分析，但每个案件都有其独特性。因此，在实际操作中，建议你咨询专业律师，以便更准确地把握案件走向和制定合适的诉讼策略。
- 灵活调整策略：在诉讼过程中，随着案件的进展和证据的收集，可能需要灵活调整诉讼策略。因此，保持与律师的密切沟通，及时调整案由和诉讼请求是非常重要的。
综上所述，选择反不正当竞争还是侵犯商业秘密作为案由，并没有一个固定的标准。而是需要根据具体案件情况、证据收集、法律适用以及诉讼策略等多方面因素进行综合考量。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。