结论：逾期超90天的情况下，公积金贷款的申请大概率会受到负面影响，能否成功申请需结合具体逾期类型、次数、当前信用状况及公积金中心政策综合判断。以下从不同角度展开分析：
1. 逾期记录对公积金贷款的核心影响
公积金贷款虽属于政策性贷款（利率低、门槛相对宽松），但审批时仍会严格审查申请人信用记录。根据《征信业管理条例》及各地公积金中心规定：
- 逾期超90天通常被认定为“严重逾期”，会直接体现在个人征信报告中，成为贷款审批的“硬性减分项”。
- 多数公积金中心要求申请人近2年内无连续3期（即90天）或累计6期以上的逾期记录，否则可能直接拒贷。
2. 能否申请成功的关键因素
即使存在逾期记录，仍需结合以下情况综合判断：
- 逾期类型：若逾期为信用卡年费、小额欠款等非恶意逾期，且已结清并附说明材料，部分公积金中心可能酌情放宽要求；但若为房贷、车贷等大额贷款逾期，拒贷风险极高。
- 逾期次数与时间：仅1次逾期超90天且已结清，部分城市可能允许申请（如需提供结清证明、收入证明等补充材料）；但若2年内多次逾期，几乎无法通过审批。
- 当前信用状况：若逾期记录已超过2年（征信报告仅保留5年内的记录），且近期信用良好（无新增逾期、负债率低），部分公积金中心可能不再将旧记录作为主要审批依据。
- 公积金中心政策差异：不同城市公积金中心对逾期的容忍度不同（如一线城市政策更严格，三四线城市可能更灵活），需以当地具体规定为准。
3. 建议行动步骤
若您希望申请公积金贷款，可按以下步骤操作：
- 自查征信报告：通过中国人民银行征信中心官网或线下网点获取详细征信报告，确认逾期记录的具体情况（如逾期金额、时间、是否已结清）。
- 咨询当地公积金中心：携带征信报告、收入证明等材料，直接向当地公积金管理中心咨询政策，明确是否符合贷款条件。
- 优化申请条件：若逾期记录影响较大，可尝试通过以下方式提高通过率：
- 增加共同借款人（如配偶信用良好）；
- 提供更高比例的首付款；
- 延长还款期限以降低月供压力；
- 结清其他小额贷款以降低负债率。
温馨提示：公积金贷款政策可能随地区和时间调整，建议以当地公积金中心最新规定为准。若您对具体操作或政策解读有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细建议。