商家违规存储锂电池并运输，主要归应急管理部门、交通运输部门以及市场监督管理部门管辖，具体取决于违规行为的性质和环节。以下从不同角度进行详细分析：

1. 应急管理部门：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国安全生产法》及相关规定，应急管理部门负责安全生产综合监督管理，包括危险化学品的生产、储存、使用、经营和运输等环节的安全监管。锂电池，特别是锂离子电池，因其化学性质活泼，若存储不当可能引发火灾或爆炸，因此被视为危险化学品或具有类似危险特性的物品。
   • 监管职责：应急管理部门有权对商家的锂电池存储设施进行安全检查，确保其符合安全生产标准。若商家违规存储锂电池，如未设置专门的安全存储区域、未配备必要的消防设施等，应急管理部门有权责令改正，并可能处以罚款等行政处罚。

2. 交通运输部门：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路运输条例》及相关规定，交通运输部门负责道路运输市场的监管，包括危险货物的运输。锂电池在运输过程中，若未按照危险货物运输的相关规定进行包装、标识和运输，将构成违规。
   • 监管职责：交通运输部门有权对商家的锂电池运输行为进行检查，确保其符合危险货物运输的标准。若商家违规运输锂电池，如未使用专用车辆、未配备必要的应急设备等，交通运输部门有权责令改正，并可能处以罚款、吊销运输许可证等行政处罚。

3. 市场监督管理部门：

   • 法律依据：市场监督管理部门负责市场秩序的监管，包括产品质量、广告宣传、消费者权益保护等方面。若商家在存储或运输锂电池过程中存在虚假宣传、销售不合格产品等行为，将构成市场监管领域的违规。
   • 监管职责：市场监督管理部门有权对商家的经营行为进行检查，确保其符合市场监管的相关规定。若商家存在违规行为，如销售未经认证或不合格的锂电池、虚假宣传锂电池的性能等，市场监督管理部门有权责令改正，并可能处以罚款、没收违法所得等行政处罚。

法律建议：

• 商家应严格遵守国家关于锂电池存储和运输的相关规定，确保锂电池的安全存储和运输。
• 若商家对相关规定不了解或存在疑问，应及时咨询相关部门或专业律师，以避免违规行为的发生。
• 若商家已因违规存储或运输锂电池而面临行政处罚或法律纠纷，应积极配合相关部门的调查和处理，并寻求专业律师的帮助以维护自身合法权益。

可能后果：

• 若商家违规存储或运输锂电池，可能面临应急管理部门、交通运输部门或市场监督管理部门的行政处罚，包括罚款、没收违法所得、吊销许可证等。
• 若商家的违规行为导致火灾、爆炸等严重后果，还可能构成犯罪，面临刑事责任的追究。

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