结论：信用卡逾期5、6年没还，一般情况下可以办理港澳通行证，但逾期行为若引发严重法律后果，则可能影响办理。以下为具体分析：

1. 办理港澳通行证的基本条件：

   • 根据我国相关法律法规，办理港澳通行证主要要求申请人具备中国公民身份、无刑事犯罪记录等基本条件，并未将信用卡逾期作为禁止办理的直接因素。因此，单纯从信用卡逾期的角度来看，它并不直接构成办理港澳通行证的障碍。

2. 信用卡逾期可能引发的法律后果：

   • 信用卡逾期未还，首先会面临银行的催收和可能的法律诉讼。如果银行选择通过法律途径追讨欠款，逾期者可能会被法院判决还款，并可能承担额外的利息、滞纳金等费用。
   • 在极端情况下，如果逾期者拒不执行法院判决，可能会被列入失信被执行人名单，这将对个人的信用记录产生严重影响，并可能限制其高消费行为，如乘坐飞机、高铁等。然而，就目前的规定而言，被列入失信被执行人名单并不直接禁止办理港澳通行证。
   • 但需注意的是，如果信用卡逾期行为涉嫌信用卡诈骗等刑事犯罪，且被公安机关立案侦查或法院判决有罪，那么这将构成刑事犯罪记录，从而可能影响港澳通行证的办理。因为办理港澳通行证要求申请人无刑事犯罪记录。

3. 实际操作中的建议：

   • 尽管信用卡逾期本身不直接禁止办理港澳通行证，但逾期者仍应尽快与银行协商解决欠款问题，以避免可能的法律诉讼和信用记录受损。
   • 如果逾期者已被列入失信被执行人名单或面临刑事诉讼风险，建议咨询专业律师以了解具体法律后果和应对策略。
   • 在办理港澳通行证时，逾期者应如实填写相关申请表格，并准备必要的证明材料。如果因信用卡逾期问题被询问或调查，应积极配合并提供相关解释和证明。