将公款放在第三方账户是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
合法情形：
- 基于合法合同或协议：如果公司因业务需要，与第三方签订了合法有效的合同或协议，明确约定将公款存入第三方账户作为履约保证金、托管资金等，且该行为符合相关法律法规的规定，那么这种行为是合法的。例如，在房地产交易中，买方可能将购房款存入第三方监管账户，以确保交易安全。
- 法院或仲裁机构指定：在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构可能根据案件需要，指定将公款存入第三方账户进行保全或执行。这种情况下，将公款存入第三方账户也是合法的。
违法情形：
- 挪用公款：如果公司工作人员未经授权，擅自将公款存入个人或第三方账户，用于个人消费、投资或其他非法目的，这种行为构成挪用公款罪，是违法的。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的，都可能构成犯罪。
- 逃避监管或税务：如果公司为了逃避金融监管、税务监管等目的，将公款存入第三方账户进行隐匿或转移，这种行为也是违法的。它可能涉及洗钱、逃税等违法行为，会受到法律的严厉制裁。
法律建议：
- 确保合法合规：公司在将公款存入第三方账户时，应确保该行为符合相关法律法规的规定，并签订合法有效的合同或协议。同时，应建立健全的内部控制制度，防止公款被挪用或滥用。
- 加强监管和审计：公司应加强对公款使用的监管和审计，确保公款的使用符合公司的经营目标和财务计划。对于发现的违规行为，应及时进行纠正和处理。
- 咨询专业律师：如果公司对将公款存入第三方账户的法律性质存在疑问，或者需要制定相关的合同或协议，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据公司的具体情况和需求，提供专业的法律建议和解决方案。
可能后果：
- 如果行为合法：公司将公款存入第三方账户的行为如果合法合规，那么不会面临法律制裁或处罚。相反，它可能有助于保障交易安全、提高资金使用效率等。
- 如果行为违法：如果公司将公款存入第三方账户的行为构成挪用公款、逃避监管或税务等违法行为，那么公司及其相关责任人员可能面临法律制裁或处罚，包括罚款、没收违法所得、刑事责任等。
总之，将公款放在第三方账户是否违法，取决于具体情形和法律规定。公司在处理此类事务时，应谨慎行事，确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。