商标行政诉讼各阶段期限的详细解答如下：
在商标行政诉讼中，各阶段的期限是确保诉讼程序顺利进行和当事人合法权益得到保障的重要环节。以下是从不同阶段对商标行政诉讼期限的详细解析：
一、直接起诉商标行政行为的期限
根据《行政诉讼法》及相关司法解释，若公民、法人或其他组织直接对商标行政行为（如商标驳回、商标异议等）提起诉讼，应当自知道或应当知道该行政行为作出之日起六个月内向人民法院提出。这一期限是基本原则，旨在平衡行政行为的稳定性与当事人的合法权益保护。
二、经复议后的起诉期限
复议决定后的起诉：若当事人对商标行政复议决定不服，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。这一期限较短，要求当事人及时行使诉讼权利。
复议机关逾期不作决定的起诉：若复议机关在法定期限内未作出复议决定，当事人可以在复议期满之日起十五日内提起诉讼。这确保了当事人在复议程序无法解决问题时，能够及时转向诉讼程序。
三、行政机关未履行法定职责的起诉期限
当当事人申请商标行政机关履行保护其合法权益的法定职责（如商标侵权查处）时，若行政机关在接到申请之日起两个月内不履行，当事人可向人民法院提起诉讼。这一期限针对的是行政机关的不作为行为，旨在促使行政机关及时履行职责。
四、特殊情形的处理
行政机关未告知诉权或起诉期限：若商标行政机关在作出行政行为时未告知当事人诉权或起诉期限，起诉期限从当事人知道或应当知道诉权或起诉期限之日起计算，但最长不得超过一年。这一规定保护了因行政机关未履行告知义务而可能错过起诉期限的当事人的权益。
不动产案件的特殊规定：虽然商标案件通常不涉及不动产，但若案件与不动产相关（如商标使用在不动产上引发的纠纷），且涉及重大利益，法律规定了更长的起诉期限。即，自行政行为作出之日起二十年内可提起诉讼。不过，这一规定在商标案件中较为罕见。
五、起诉期限的计算、扣除与延长
计算方式：起诉期限通常按自然日计算，不包含法定节假日和休息日。若最后一日为节假日或休息日，则可顺延至节假日或休息日后的第一个工作日。
扣除：若当事人因不可抗力或其他不属于其自身原因耽误起诉期限，被耽误的时间不计入起诉期限内。这确保了当事人在遭遇不可抗力等特殊情况时，不会因无法行使诉讼权利而受损。
延长：在特定情况下，当事人可能因正当理由无法在法定期限内提起诉讼。此时，当事人可在障碍消除后十日内向人民法院申请延长起诉期限，是否准许由人民法院决定。这提供了当事人在特殊情况下申请延长起诉期限的途径。
总结与建议：
商标行政诉讼各阶段的期限是确保诉讼程序顺利进行和当事人合法权益得到保障的重要环节。当事人在提起商标行政诉讼时，应充分了解并严格遵守这些期限规定。同时，由于商标行政诉讼涉及复杂的法律问题和程序要求，建议当事人在遇到相关问题时及时向我咨询，以便更好地维护自己的合法权益。