核心结论：农商银行贷款被系统自动扣款用于偿还网贷，可能涉及资金归属、合同履行、法律责任等多方面问题，具体影响需分情况讨论。以下是详细分析：

1. 若自动扣款行为符合合同约定

• 资金归属合法：若您与农商银行签订的贷款合同中明确约定了“自动扣款权限”（如授权银行在特定条件下从账户划扣资金），且扣款用途包含偿还其他债务（如网贷），则银行行为可能合法。此时，资金被划扣后，您对网贷平台的债务可能因还款而部分或全部消灭。
• 合同履行义务：您需确认网贷平台是否已收到还款。若银行扣款后未及时将资金转至网贷平台，可能导致您仍需向平台还款，甚至产生逾期记录。此时，您可要求银行提供扣款凭证，并协调网贷平台确认还款状态。

2. 若自动扣款行为违反合同约定或未经授权

• 银行可能承担违约责任：若贷款合同未约定自动扣款权限，或未明确扣款用途包含偿还网贷，银行擅自扣款可能构成违约。您可要求银行返还被扣资金，并赔偿因此造成的损失（如网贷逾期产生的罚息、信用损失等）。
• 网贷平台无权直接扣款：若扣款是网贷平台通过银行系统直接划扣（而非银行主动操作），需区分两种情况：
  • 您曾授权平台扣款：若您在签订网贷合同时授权平台在还款日从绑定账户扣款，则平台行为合法，但需确保扣款金额与合同约定一致。
  • 未授权或超额扣款：若平台未经授权或超额扣款，可能构成侵权或违约。您可要求平台返还多余款项，并向监管部门投诉或通过法律途径维权。

3. 潜在法律风险与建议

• 信用风险：若扣款导致您对农商银行的贷款逾期（如账户余额不足未及时补足），可能影响个人征信。建议立即联系银行说明情况，协商解决方案。
• 证据保留：无论扣款是否合法，均需保留相关证据（如合同、扣款记录、沟通记录等），以便后续维权。
• 协商与投诉：若与银行或网贷平台协商无果，可向当地银保监会、金融消费权益保护局等监管部门投诉，或通过诉讼、仲裁等途径解决争议。

总结：农商银行贷款被自动扣款偿还网贷的影响需结合合同约定、授权情况及实际扣款流程综合判断。建议您首先核对贷款合同和网贷合同的条款，确认扣款是否合法；若存在争议，及时收集证据并咨询专业法律意见，以维护自身权益。如有进一步问题，可直接向我提问。