您好，针对您提出的“车辆在高速上发生故障由拖车带下高速，通行费怎么缴纳”的问题，以下是我的详细解答：
首先，根据《收费公路车辆通行费车型分类》(JT/T 489-2009)的规定，通行收费公路的车型是分别按照客车、货车和专项作业车三个系列进行分类的。当机动车拖拽另一辆机动车（如故障车辆）通行收费公路时，这实际上被视为两辆车在同时通行收费公路。
通行费的缴纳原则：
各自车型分类收费：牵引车（即拖车）和被牵引的故障车辆，应分别按照它们各自的车型分类进行收费。这意味着，如果牵引车是货车，就按照货车的收费标准来计费；如果故障车辆原本是客车，就按照客车的收费标准来计费。
特殊情况处理：对于牵引车和挂车组成的货车列车或半挂汽车列车，它们会按照牵引车和挂车合并后的轴数来进行车型分类和收费。不过，这一规定主要适用于正常的运输车辆组合，对于故障车辆的拖拽情况，通常还是按照各自车型分类来收费。
实际操作建议：
当您的车辆在高速上发生故障并需要拖车服务时，建议您在联系拖车公司时，就明确询问关于通行费缴纳的具体事宜，包括是否需要为故障车辆单独缴纳通行费，以及拖车公司的收费标准中是否已包含通行费等。
在拖车将故障车辆带下高速时，您可能需要向收费站工作人员出示相关证明（如拖车服务合同、故障车辆行驶证等），以便工作人员能够准确判断并收取相应的通行费。
如果您对通行费的缴纳有任何疑问或争议，可以及时向收费站工作人员或拖车公司提出，并寻求他们的帮助和解释。
综上所述，当车辆在高速上发生故障并由拖车带下高速时，通行费的缴纳是按照牵引车和故障车辆各自的车型分类来进行的。希望这个解答能够帮助您更好地理解通行费的缴纳原则，并在实际遇到问题时能够妥善处理。