关于法院拍卖资产时评估公司的评估合法性问题，这是一个涉及法律程序和专业评估的复杂但关键的过程。以下我将详细解释评估公司如何合法地进行资产评估，以确保整个拍卖过程的公正性和合法性。

首先，评估公司的选择是至关重要的。法院在拍卖资产前，会委托具有合法资质和良好信誉的评估机构进行资产评估。这些评估机构通常需要经过严格的审核和认证，确保它们具备进行专业评估的能力和经验。选择评估机构时，法院会考虑其过往业绩、专业资质、行业声誉等多个方面，以确保评估结果的客观性和准确性。

接下来，评估方法的运用也是评估合法性的关键。评估机构在接受法院委托后，会采用市场法、成本法、收益法等合适的评估方法，对查封、扣押的资产进行全面、细致的评估。这些方法都是国际上通行的评估标准，能够确保评估结果的公正性和合理性。评估过程中，评估机构会充分考虑资产的市场价值、使用状况、未来收益潜力等多个因素，以得出最准确的评估结果。

在评估过程中，评估报告的出具也是必不可少的环节。评估机构在完成评估后，会出具详细的评估报告，明确列出评估方法、评估过程、评估结果等关键信息。这份报告是确定拍卖保留价的重要依据，也是法院判断资产价值、保障各方当事人合法权益的重要参考。因此，评估报告的出具必须严格遵守法律法规和评估准则，确保报告的合法性和有效性。

此外，法院的监督与审查也是确保评估合法性的重要保障。在整个评估过程中，法院会对评估机构的工作进行监督和审查，确保评估机构按照法律法规和评估准则进行评估，没有违规操作或不当行为。如果法院发现评估机构存在违规行为或评估结果不准确，会及时要求评估机构进行纠正或重新评估，以确保拍卖过程的公正性和合法性。

最后，当事人的权利保障也是评估合法性的重要体现。在整个拍卖过程中，当事人有权对评估结果提出异议或申诉。如果当事人认为评估结果不准确或存在违规行为，可以向法院提出异议或申诉，法院会依法进行审查和处理，确保当事人的合法权益得到保障。

综上所述，法院拍卖资产时评估公司的评估合法性是通过严格的选择评估机构、运用合适的评估方法、出具详细的评估报告、法院的监督与审查以及当事人的权利保障等多个环节来确保的。这些措施共同构成了一个严谨、公正、合法的评估体系，为法院拍卖资产提供了有力的法律保障。