协议书上只签字没按手印，在一般情况下是有效的。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一条款明确指出了签名、盖章和按指印三种方式在法律上具有同等的效力，都是合同成立的有效方式。也就是说，签字本身就足以表明当事人对协议内容的认可和愿意受其约束，按手印并非合同成立的必要条件。

签字有效性角度

签字是当事人真实意思表示的一种重要体现形式。只要协议内容是双方自愿协商达成的，不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方都具有相应的民事行为能力，那么即使协议上只有签字而没有手印，该协议也是有效的。例如，甲和乙签订了一份房屋租赁合同，双方在合同上签字确认，虽然没有按手印，但只要这份合同是双方自愿协商达成的，房屋租赁也不违反法律法规，那么这份合同就是有效的，对甲和乙都具有法律约束力。

特殊情况考量角度

在某些特殊情况下，如果当事人在协议中明确约定必须同时签字并按手印协议才生效，那么此时仅有签字而没有手印，协议可能不满足生效条件。因此，在签订协议时，应仔细阅读并理解协议中的全部条款，特别是关于生效条件的约定。比如，一些涉及重大经济利益或者特殊行业要求的协议，当事人可能会在协议中特别约定生效方式，此时就需要按照约定来履行。

对方不承认的影响角度

如果对方不承认签协议时只签字没按手印，这并不影响协议的法律效力。因为协议的有效性主要取决于双方是否自愿、平等地达成协议，并且协议内容是否合法、明确。对方的不承认可能构成违约行为，但这需要通过法律途径来解决，如提起诉讼或申请仲裁等。在实际操作中，如果发生纠纷，签字本身就可以作为重要的证据来证明协议的存在和有效性。如果对方对签字有异议，可以通过笔迹鉴定等方式来确认签字的真实性。

实际操作建议角度

尽管签字、盖章或按手印中的任何一种方式都能使合同成立并生效，但在实际操作中，为了确保协议的有效性和真实性，建议在签署重要协议时还是尽量按照法律规定和常规做法进行操作。例如，在可能的情况下，可以同时采用签字和按手印的方式，以增强协议的证明力。同时，应妥善保管好协议原件，以备不时之需。在协议执行过程中，如有任何疑问或争议，应及时向我咨询，以便得到准确的解答和帮助。

综上所述，协议书上只签字没按手印并不影响其有效性，但为了确保协议的法律效力和避免纠纷，建议按照法律规定的形式和要求来签订和保管协议。如果你在协议签订或执行过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询。