公司秘书制度的法律依据主要来源于公司法及相关法规的规定。在我国，公司秘书制度的具体法律依据可以归纳如下：

1. 《中华人民共和国公司法》：虽然《公司法》中并未直接提及“公司秘书”这一职位，但规定了上市公司应当设立董事会秘书，负责公司股东大会和董事会会议的筹备、文件保管以及公司股东资料的管理，办理信息披露事务等事宜。董事会秘书在上市公司中扮演着重要的角色，其职责与公司秘书有相似之处。

2. 其他相关法规及规范性文件：

   • 如某些地方曾出台过关于公司秘书管理的具体办法（虽已废止，如珠海市商事主体公司秘书管理办法），这些办法对公司秘书的设立、职责、备案等事项进行了详细规定。虽然这些地方性法规可能因时间或地域的不同而有所差异，且部分可能已不再适用，但它们为公司秘书制度的建立提供了参考。
   • 此外，证监会、交易所等监管机构发布的关于上市公司信息披露、董事会秘书职责等的相关规定，也是公司秘书制度法律依据的重要组成部分。

3. 法律实践及司法解释：

   • 在法律实践中，法院对于公司秘书（或董事会秘书）在信息披露、文件管理等方面的失职行为，通常会依据相关法律法规及监管规定进行裁决。这些司法实践为公司秘书制度的完善提供了重要的参考。

综上所述，公司秘书制度的法律依据主要来源于《中华人民共和国公司法》及相关法规、规范性文件以及法律实践。虽然《公司法》中并未直接规定公司秘书的设立及职责，但通过对上市公司董事会秘书的规定以及其他相关法规的补充，我们可以构建起一套相对完善的公司秘书制度体系。如果您在公司秘书制度方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。