驾驶机动车在高速公路行车道上违法停车是一种严重的交通违法行为，其处罚标准明确且严格，主要包括罚款和扣分两个方面。以下是对此问题的详细解答：
一、基本处罚标准
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将处警告或者二十元以上二百元以下罚款。在实际执行中，对于在高速公路行车道上违法停车的行为，一般会被处以200元罚款。
扣分：
- 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，驾驶机动车在高速公路上违法停车的，将面临扣分处罚。具体而言，驾驶营运客车以外的车辆在行车道上违规停车的，一次记9分；而驾驶营运客车在行车道上违规停车的，则更为严厉，一次记12分。
二、不同情形下的具体处罚
驾驶营运客车以外的机动车在高速公路行车道上停车：
驾驶营运客车在高速公路行车道上停车：
非紧急情况下在应急车道上停车：
- 无论驾驶的是营运客车还是其他车辆，均罚款200元。驾驶营运客车时记12分，驾驶营运客车以外的车辆时记9分。
车辆发生故障或事故后未按规定使用灯光和设置警告标志：
- 罚款200元，记3分。此时，驾驶员应按规定使用紧急灯光示警，并在来车方向的适当距离（如150米之外）设置故障车警告标志。
三、特殊情况的处理
- 如果机动车在高速公路上发生故障或事故，确需临时停车的，驾驶员应立即开启危险报警闪光灯，并在规定距离内设置警告标志，以提醒后来车辆注意安全。在这种情况下，一般不会被处罚，但驾驶员应尽快处理完毕并驶离现场。
四、其他处罚措施
- 如果机动车驾驶人不在现场或者虽在现场但拒绝立即驶离，妨碍其他车辆、行人通行的，公安机关交通管理部门有权将其车辆拖移至不妨碍交通的地点或指定的地点停放。
五、违法停车的危害与法律责任
- 高速公路车流量大、车速快，违法停车不仅严重影响高速公路的正常通行秩序，还极易引发追尾、碰撞等严重交通事故，危及自己和其他过往司乘人员的生命财产安全。
- 如果因违规停车导致人员伤亡或重大财产损失，停车当事人可能还需承担相应的民事赔偿责任甚至刑事责任。
总结与建议：
驾驶人在高速公路上行驶时，应严格遵守交通规则，不得随意停车。如遇紧急情况需停车，应按照规定采取安全措施，并及时报警。通过加强交通安全意识，共同维护高速公路的安全与畅通。希望每位驾驶人都能牢记这些规定，确保自己和他人的安全。