结论：公司简易注销公示期有异议但仍在公示，可能是因为企业尚未收到异议通知、未及时处理异议，或异议处理流程尚未完成。企业应立即暂停注销程序，调查核实异议内容，并与异议人积极沟通协商，确保异议得到妥善处理后再继续注销流程。

一、可能的原因分析

1. 企业未收到异议通知：

   • 异议可能已通过国家企业信用信息公示系统提出，但企业尚未关注到或未收到相关通知。
   • 建议：企业应定期登录国家企业信用信息公示系统，查看简易注销公告的异议留言功能，确保及时获取异议信息。

2. 企业未及时处理异议：

   • 企业可能已收到异议通知，但尚未采取行动进行调查核实或沟通协商。
   • 建议：企业应立即暂停简易注销程序，对异议内容进行深入调查核实，并与异议人取得联系，了解其具体诉求和意见。

3. 异议处理流程尚未完成：

   • 异议处理可能需要一定时间，包括调查核实、沟通协商、补充材料等环节。
   • 建议：企业应积极配合登记机关和异议人的要求，提供必要的证明材料或对相关问题进行说明，确保异议处理流程顺利进行。

二、企业的应对措施

1. 暂停注销程序：

   • 一旦收到合法有效的异议，企业应立即暂停简易注销程序，以保障异议人的合法权益。

2. 调查核实与沟通协商：

   • 企业应对异议内容进行深入调查核实，确保异议处理的准确性和公正性。
   • 积极与异议人取得联系，了解其具体诉求和意见，通过友好协商解决异议问题。若能达成和解，应及时向登记机关报告并提供证明材料。

3. 补充材料或说明情况：

   • 根据登记机关的要求，企业可能需要补充相关材料或对特定问题作出说明，以协助登记机关更好地了解异议情况。

三、登记机关的处理方式

1. 异议审查与裁定：

   • 登记机关将对异议进行全面审查，并根据调查结果作出裁定。若异议成立，将终止简易注销程序；若异议不成立，将继续推进简易注销程序。

2. 要求企业配合调查：

   • 在异议处理过程中，登记机关有权要求企业提供必要的证明材料或对相关问题进行说明。企业应积极配合，确保调查工作的顺利进行。

四、异议处理后的后续程序

1. 恢复注销程序或按一般注销程序办理：

   • 若异议得到妥善解决，企业可向登记机关申请恢复简易注销程序。
   • 若异议无法解决或异议成立导致注销申请被驳回，企业则需按照一般注销程序重新申请注销，包括成立清算组、通知公告债权人、清算与分配、注销登记等步骤。

2. 法律途径解决争议：

   • 若双方无法就异议达成一致，异议人可通过诉讼、仲裁等法律途径维护自己的合法权益。在法律程序终结之前，企业的注销程序将处于暂停状态。

五、注意事项与建议

1. 确保材料真实完整：

   • 企业在申请简易注销时，应确保所提交材料的真实性和完整性，避免因材料问题引发异议。

2. 及时响应异议通知：

   • 一旦收到异议通知，企业应尽快处理并响应，以免影响注销进度和自身权益。

3. 严格遵守法律法规：

   • 在整个注销过程中，企业必须严格遵守相关法律法规，确保注销的合法性和有效性。同时，建议企业寻求专业法律人士的帮助和指导，以确保异议处理的准确性和合规性。

企业在面对简易注销公示期有异议的情况时，应保持冷静、积极应对，确保异议得到妥善处理并顺利完成注销程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。