改装车辆的处罚主体主要是公安机关交通管理部门，同时根据改装行为的不同性质和后果，还可能涉及道路运输管理机构、市场监督管理部门等其他相关部门。以下是对这一问题的详细分析：
一、公安机关交通管理部门的处罚
一般改装行为：
- 若车主改变车身颜色、更换发动机、车身或车架等关键部件，而未在规定时限内向公安机关交通管理部门申请变更登记，将面临警告或200元以下罚款的处罚。这是依据《机动车登记规定》的相关条款进行的处罚，旨在确保车辆信息的准确性，便于交通管理。
擅自改装行为：
- 对于擅自改变机动车外形和已登记的有关技术数据的行为，如加装大包围、尾翼、改变轮胎规格等，公安机关交通管理部门将责令恢复原状，并处以警告或500元以下罚款。此举旨在维护车辆的原始设计安全性和行驶稳定性。
严重改装行为：
- 若车辆非法改装后用于追逐竞驶等危害公共安全的活动，根据情节轻重，将受到不同层次的处罚。尚不构成犯罪的，可处200元以上2000元以下罚款，并可吊销机动车驾驶证；构成犯罪的，则依据《中华人民共和国刑法》相关规定，以危险驾驶罪论处，处拘役并处罚金。
二、道路运输管理机构的处罚
- 改装营运车辆：
- 若非法改装车辆后从事道路运输经营活动，将由道路运输管理机构责令改正，并处以5000元以上2万元以下的罚款。此规定旨在规范道路运输市场，确保运输安全。特别是对于擅自改装已取得车辆营运证的车辆，处罚更为严厉，可能面临停运整顿的行政措施，甚至吊销经营许可证。
三、市场监督管理部门的处罚
- 非法生产、销售拼装或擅自改装的机动车：
- 对于生产、销售拼装的机动车或者生产、销售擅自改装的机动车的行为，市场监督管理部门将没收非法生产、销售的机动车成品及配件，并可以并处非法产品价值三倍以上五倍以下的罚款。对于有营业执照的，还将吊销其营业执照；对于没有营业执照的，将予以查封处理。
四、综合建议
- 合法改装：车主在进行车辆改装前，应充分了解相关法律法规，确保改装行为合法合规。例如，小型或微型载客汽车加装前后防撞装置、货运机动车加装水箱、防风罩、备胎架及工具箱等部件，以及增加机动车辆车内的装饰等，在符合相关规定的前提下是被允许的。
- 及时办理变更登记：若车主进行了需要变更登记的改装行为，如改变车身颜色、更换发动机等，应及时向公安机关交通管理部门申请变更登记，以避免不必要的法律风险。
- 避免非法改装营运车辆：对于营运车辆的经营者来说，更应严格遵守相关法律法规，不得擅自改装车辆，以确保道路运输的安全与合法。
改装车辆的处罚主体涉及多个部门，具体处罚措施和主体取决于改装行为的性质和严重程度。车主和驾驶人在进行车辆改装时，务必遵守相关法律法规，确保改装行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。