蓝牌摩托车发动机排量与合格证不符，属于违法行为，可能面临行政处罚，情节严重的还可能涉及刑事处罚。具体处罚情况需根据实际违法情节和后果来判定，以下分情况详细说明：

1. 行政处罚层面

   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，机动车必须与合格证等法定文件记载的信息一致。若发动机排量与合格证不符，属于擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征，违反了机动车登记管理规定。
   • 处罚措施：
     • 罚款：公安机关交通管理部门可对违法行为人处以200元以上2000元以下罚款。
     • 扣留车辆：若车辆存在严重安全隐患或无法当场整改，交警部门有权扣留车辆，直至违法行为消除。
     • 责令恢复原状：要求车主将车辆恢复至与合格证一致的状态，包括更换符合排量的发动机等。
     • 吊销驾驶证：若违法行为人同时存在无证驾驶、驾驶与准驾车型不符等情形，还可能面临吊销驾驶证的处罚。

2. 刑事处罚层面（极端情况）

   • 涉嫌犯罪的情形：若发动机排量与合格证不符的行为涉及生产、销售伪劣产品，且数额较大或造成严重后果，可能构成生产、销售伪劣产品罪。例如，商家故意篡改合格证信息，以次充好销售摩托车，且销售金额达到一定标准。
   • 处罚措施：根据《中华人民共和国刑法》第一百四十条，生产、销售伪劣产品罪可处二年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；情节严重的，刑罚更重。

3. 其他法律后果

   • 保险理赔问题：若摩托车因排量不符发生交通事故，保险公司可能以“车辆信息与投保时不符”为由拒绝理赔。
   • 车辆年检问题：排量不符的摩托车无法通过年检，需整改后才能重新上路。
   • 民事赔偿责任：若因排量不符导致交通事故，车主可能需承担更大的民事赔偿责任。

建议：若您发现蓝牌摩托车发动机排量与合格证不符，应立即停止使用该车辆，并联系销售商或生产厂家协商解决。若协商无果，可向当地市场监督管理部门或公安机关交通管理部门投诉举报。同时，若您因该问题面临法律纠纷或处罚，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。