部门拒绝房地一体确权登记，可能违反了以下相关法律法规：

1. 《中华人民共和国民法典》的相关规定：

   • 根据《民法典》中关于物权的规定，房屋和土地作为不动产，其所有权和使用权应当依法进行登记，以确认和保护权利人的合法权益。房地一体确权登记是确保房屋所有权和土地使用权一致性的重要手段。如果部门拒绝进行这样的登记，可能违反了《民法典》中关于物权登记和保护的基本原则。

2. 《不动产登记暂行条例》的具体要求：

   • 《不动产登记暂行条例》明确规定了不动产登记的范围、程序、要求等。其中，房地一体确权登记是不动产登记的重要组成部分。如果部门拒绝按照条例要求进行房地一体确权登记，就违反了该条例的具体规定，可能面临法律责任。具体来说，该条例第五条规定了不动产权利的登记范围，包括集体土地所有权，房屋等建筑物、构筑物所有权等，这为房地一体确权登记提供了法律依据。

3. 地方性法规或规章的可能规定：

   • 除了国家层面的法律法规外，各地还可能根据本地实际情况制定了相关的地方性法规或规章。这些地方性法规或规章可能对房地一体确权登记有更具体的规定和要求。如果部门拒绝登记的行为违反了这些地方性法规或规章，同样可能面临法律责任。

可能面临的法律后果：

• 如果部门拒绝房地一体确权登记的行为被认定为违法，可能会面临行政复议或行政诉讼的风险。在行政复议或行政诉讼中，如果部门无法提供充分的理由和证据来支持其拒绝登记的行为，那么其决定可能会被撤销或变更，并可能需要承担相应的法律责任。

建议：

• 如果您遇到了部门拒绝房地一体确权登记的情况，首先可以尝试与部门进行沟通，了解其拒绝的具体原因和依据。
• 如果沟通无果，您可以考虑向上一级行政机关申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
• 在整个过程中，建议您咨询专业的律师，以获取更具体、更专业的法律建议和帮助。

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