核心结论：面对车款逾期公司发消息要保全车辆并主张违约金的情况，您需要先核实合同条款，再根据自身逾期原因及合同约定，采取协商、应对保全、处理违约金等相应措施。以下为详细说明：

一、核实合同条款

首先，您需要仔细查看购车合同中关于逾期付款、车辆保全以及违约金的相关条款。这是后续处理问题的基础和依据。

1. 逾期付款条款：明确合同中约定的付款期限、逾期付款的认定标准以及逾期后的处理方式。比如，合同可能规定逾期超过一定天数即视为违约，公司有权采取相应措施。
2. 车辆保全条款：了解合同中是否赋予了公司在特定情况下对车辆进行保全的权利，以及保全的具体方式和条件。有些合同可能约定，在购车人逾期付款且经催告后仍未履行付款义务时，公司有权对车辆进行保全，如扣留车辆等。
3. 违约金条款：查看合同中关于违约金的约定，包括违约金的计算方式、金额上限等。这有助于您了解公司主张的违约金是否合理合法。

二、分析逾期原因及合同约定

在核实合同条款后，您需要分析自己逾期付款的原因，并结合合同约定来判断公司的要求是否合理。

1. 非自身原因逾期：如果您逾期付款是由于不可抗力因素（如自然灾害、政府行为等）或公司原因（如公司未按时交付车辆、提供的车辆存在质量问题等）导致的，您可以与公司协商，要求免除或减轻违约责任，并拒绝公司不合理的保全和违约金要求。
2. 自身原因逾期：如果您逾期付款是由于自身原因（如资金周转困难、疏忽大意等）导致的，那么您需要承担相应的违约责任。但即便如此，您也有权要求公司按照合同约定合理行使权利，不得过度保全或主张过高的违约金。

三、应对措施

根据上述分析，您可以采取以下措施来应对公司发消息要保全车辆并主张违约金的情况：

1. 与公司协商：主动与公司沟通，说明逾期原因，表达还款意愿，并尝试协商延期还款、分期还款或减免部分违约金等方案。通过协商，往往可以达成双方都能接受的解决方案。
2. 应对车辆保全：如果公司已经对车辆采取了保全措施（如扣留车辆），您需要了解保全的合法性和合理性。如果保全措施违反了合同约定或法律规定，您可以向公司提出异议，并要求解除保全措施。必要时，您可以寻求法律援助或向法院提起诉讼。
3. 处理违约金问题：对于公司主张的违约金，您需要仔细核对合同约定和实际情况。如果违约金过高或不合理，您可以与公司协商降低违约金金额。如果协商无果，您可以根据法律规定向法院或仲裁机构申请调整违约金数额。

四、法律途径

如果协商无果，且您认为公司的要求严重侵犯了您的合法权益，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。

1. 提起诉讼：您可以向法院提起诉讼，要求法院判决公司解除车辆保全措施、降低违约金数额或免除违约责任等。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张。
2. 申请仲裁：如果购车合同中约定了仲裁条款，您还可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序相对简便快捷，且仲裁裁决具有法律效力。

在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语冲突。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。