销售假冒注册商标的商品罪中，违法所得数额应认定为获利数额，即销售金额扣除直接用于经营活动的合理支出后的剩余数额。以下是对此问题的详细分析：

一、违法所得数额的认定原则

在销售假冒注册商标的商品罪中，违法所得数额的认定并非简单地等同于销售金额。根据刑法修正案（十一）的修改，以及相关司法解释和行政法规的规定，违法所得数额应理解为获利数额。这一认定原则有助于更准确地反映犯罪行为的实际危害性和犯罪人的非法获利情况。

二、合理支出的扣除范围

在计算违法所得数额时，需要扣除直接用于经营活动的合理支出。然而，合理支出的扣除范围在实践中存在一定争议。一般来说，可以扣除的合理支出应限于与售假行为直接相关的成本，如购进价款等。对于其他费用，如广告费用、物流费用、包装费用、赠品采购费用以及房屋租金、水电费、雇用人员工资等，通常不应扣除。这是因为这些费用属于犯罪成本的一部分，根据任何人均不得从其犯罪活动获利的原则，不应从违法所得中扣除。

具体来说：

1. 纯粹以售假为目的的销售行为：

   • 仅扣除购进价款作为合理支出。
   • 其他相关费用，如人员工资、运费、仓储费等，均视为犯罪成本，不予扣除。

2. 真假混同的销售行为：

   • 对于未建立完备财务账册的，可推定具有规避处罚的目的，参考纯粹售假行为的处理方式。
   • 对于可以提供相关财务账册的，以核算查证的非法与合法开支数额，扣除相关合法开支。具体可以扣除的合理开支包括人员工资、运输费用、仓储费用等项目。
   • 对于合法与非法混同导致无法区分出具体核减项目部分的，可以从有利于被告人角度从宽核减幅度。

三、特殊情况的处理

对于按照上述步骤处理后仍然存在争议的部分，如相关经营活动产生的管理费用、财务费用、税费、广告、宣传费用等，原则上不计入扣除范围。但是，在考虑相关活动的正当性时，可以适度调整并在量刑时予以适当从宽。

四、法律建议

1. 对于犯罪嫌疑人或被告人：

   • 在面临销售假冒注册商标的商品罪指控时，应积极配合调查，提供真实的财务账册和交易记录。
   • 争取在合理范围内扣除直接用于经营活动的合理支出，以准确反映自己的非法获利情况。

2. 对于执法和司法机关：

   • 在办理销售假冒注册商标的商品罪案件时，应严格按照法律规定和司法解释的要求，准确认定违法所得数额。
   • 加强对犯罪成本扣除范围的审查和判断，确保量刑的公正性和合理性。

3. 对于一般公众：

   • 应增强对知识产权的保护意识，不购买、不使用假冒注册商标的商品。
   • 如发现销售假冒注册商标的商品行为，应及时向相关部门举报。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于知识产权或专利权方面的问题，欢迎随时向我咨询。