公司法定代表人申请商标，费用可以由公司支付。以下从不同角度为你详细分析：

从法律关系角度

• 法定代表人行为性质：公司法定代表人是代表公司行使职权的负责人，其以公司名义从事的民事活动，法律后果一般由公司承受。当法定代表人为了公司利益，以公司名义申请商标时，该行为属于公司行为。
• 费用承担依据：既然申请商标的行为是公司行为，那么由此产生的费用，包括商标申请费、代理费等，自然应当由公司承担。这就如同公司委托员工办理其他业务事项，所产生的合理费用由公司报销一样。

从实际操作角度

• 财务处理：在公司财务实际操作中，法定代表人申请商标的费用，可以凭借相关的发票、申请文件等凭证，作为公司的业务支出进行入账处理。这样既符合财务规范，也能清晰反映公司的经营成本。
• 避免纠纷：明确费用由公司支付，可以避免法定代表人个人与公司之间因费用问题产生纠纷，保障公司内部关系的和谐稳定。

从特殊情况角度

• 若法定代表人以个人名义申请商标：如果法定代表人没有以公司名义，而是以个人名义申请商标，那么该商标申请行为就属于其个人行为，费用原则上应当由法定代表人个人承担。但如果在申请过程中，公司明确表示愿意承担该费用，或者双方有特殊约定，那么费用也可以由公司支付。不过，这种情况下需要公司有明确的书面文件或决议来证明其愿意承担费用，以避免后续可能出现的法律风险。

法律建议：

1. 明确费用承担方式：为了避免后续可能出现的费用纠纷，建议在公司内部明确规定法定代表人申请商标的费用承担方式。可以通过公司章程、内部规章制度或者双方签订的协议等方式进行明确。
2. 保留相关凭证：无论是公司支付还是法定代表人个人支付申请商标的费用，都应当保留好相关的凭证，如发票、申请文件、付款记录等。这些凭证在后续可能出现的纠纷中，将起到重要的证明作用。

如果你在商标申请费用支付方面还有其他疑问，或者遇到相关的法律问题，可以直接向我咨询。