面对专利案件被罚1000万的情况，核心应对策略如下，我将分情况详细说明：

1. 立即审查处罚决定的合法性与合理性
   首先需确认处罚主体是否具有法定权限（如国家知识产权局或地方市场监管部门），处罚依据是否明确（如《专利法》第65条关于侵权赔偿的规定或第68条关于假冒专利的处罚条款）。若处罚决定存在程序违法（如未依法送达、未告知救济权利）或实体错误（如错误认定侵权事实、计算赔偿基数错误），可依法申请行政复议或提起行政诉讼。例如，若实际侵权获利远低于1000万，可主张赔偿数额过高并要求重新核算。

2. 评估是否构成刑事犯罪风险
   若处罚涉及假冒专利罪（《刑法》第216条），需立即核查是否达到刑事立案标准（如违法所得数额在10万元以上或造成严重后果）。若存在刑事风险，应第一时间委托律师介入，通过自首、立功、赔偿谅解等情节争取从宽处理，同时审查侦查程序合法性（如搜查、扣押是否合规）。

3. 制定分阶段应对方案

   • 行政阶段：在收到处罚决定书之日起60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼，重点攻克证据链薄弱环节（如专利稳定性分析、侵权比对报告）。
     
   • 民事阶段：若同时面临民事赔偿诉讼，可主张“行政处罚与民事赔偿竞合”，要求法院在民事判决中扣减已缴纳的行政罚款，避免双重处罚。
     
   • 刑事阶段：若已进入刑事程序，需通过“刑事合规整改”争取不起诉或缓刑，例如制定专利管理制度、开展员工培训等。

4. 探索和解与调解路径
   若侵权事实基本成立，可主动与权利人协商和解，通过签订专利许可协议、支付合理使用费等方式化解纠纷。行政机关主持的调解（如市场监管部门组织的行政调解）具有效率高、成本低的优势，调解协议可申请司法确认赋予强制执行力。

行动建议：立即整理全部案件材料（包括处罚决定书、专利文件、侵权证据等），委托专利律师进行“法律体检”，重点分析：

• 专利稳定性（是否可能被无效）
  
• 侵权比对结果（是否落入保护范围）
  
• 赔偿计算依据（是否采用法定赔偿或惩罚性赔偿）
  

提示：专利案件具有高度专业性，赔偿数额常涉及技术特征比对、市场价值评估等复杂问题，需由同时具备技术背景与法律经验的律师处理。如有进一步材料或疑问，可直接向我提供具体案情，我将为您定制应对方案。