公司注册商标并非直接由法务部门负责，而是需要向国家知识产权局商标局提交申请，由商标局进行审查注册。不过，法务部门在公司商标注册过程中确实扮演着重要的角色，以下从多个角度为您详细分析：

1. 商标注册的主管机关：

   • 根据《中华人民共和国商标法》及2018年的机构改革方案，商标注册和管理工作主要由国家知识产权局负责，具体由商标局承担商标审查注册、行政裁决等职责。因此，无论是公司还是个人，在需要注册商标时，都应向国家知识产权局（或其指定的受理机构）提交申请。

2. 法务部门在商标注册中的作用：

   • 前期准备：法务部门通常负责商标注册前的准备工作，包括商标查询、评估商标注册风险、准备商标注册申请文件等。这些工作对于确保商标注册的成功率至关重要。
   • 申请提交与跟进：虽然商标注册申请需要向国家知识产权局提交，但法务部门可以协助公司完成申请文件的准备和提交，并跟进商标注册的进展情况，及时处理可能出现的异议或驳回等问题。
   • 后续管理：商标注册成功后，法务部门还负责商标的后续管理工作，包括商标的续展、变更、转让、许可使用等事宜，确保商标的合法使用和维护。

3. 商标注册流程与法务部门的参与：

   • 提交申请：公司可以通过多种途径提交商标注册申请，包括自行前往商标局受理窗口、通过商标局官网的网上服务系统在线提交，或委托依法设立的商标代理机构办理。在这一过程中，法务部门可以提供专业的指导和协助。
   • 商标审查：商标局依法对提交的商标申请进行审查，符合条件的予以注册并公告。法务部门可以关注审查进展，及时应对可能出现的审查意见或驳回通知。
   • 注册公告与领证：商标注册成功后，商标局会发布注册公告，并颁发商标注册证书。法务部门可以协助公司领取证书，并妥善保管相关文件。

4. 法务部门在商标保护中的职责：

   • 商标侵权监测：法务部门应定期监测市场上的商标使用情况，及时发现并制止商标侵权行为。
   • 维权行动：一旦发现商标被侵权，法务部门应迅速采取行动，包括发送警告函、提起诉讼或申请仲裁等，维护公司的商标权益。

建议：虽然法务部门在公司商标注册过程中扮演着重要的角色，但商标注册的具体行政工作仍需由国家知识产权局商标局完成。因此，公司在注册商标时，应确保与法务部门紧密合作，同时遵循相关法规，通过正规途径向商标局提交申请。如果您在商标注册或保护方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。