针对您提出的关于对使用涂改、伪造、变造的烟草专卖许可证处罚时的注意事项，以下是我为您提供的详细解答：
首先，必须明确的是，根据《烟草专卖许可证管理办法》的相关规定，任何企业或者个人都不得涂改、伪造、变造烟草专卖许可证，这是违法的行为，一旦发现，将会受到相应的处罚。具体处罚措施为：由烟草专卖局处以1000元以下的罚款。
在处罚过程中，烟草专卖行政主管部门会遵循一系列严格的程序和责任事项，以确保处罚的公正性和合法性。这些程序和责任事项主要包括：
立案责任：烟草专卖行政主管部门在发现当事人涉嫌违法行为的，应当及时进行审查，并决定是否立案。这是处罚程序的第一步，确保了对违法行为的及时发现和处理。
调查责任：立案后，烟草专卖行政主管部门会指定2名以上的执法人员对当事人的违法行为进行调查。调查方式包括现场勘查、拍照、询问等，以确保获取充分的证据。在调查过程中，执法人员需要出示证件、表明身份，与案件有利害关系的人应当回避，以确保调查的公正性。
审查责任：对案件的违法事实、证据、程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人的陈述说明等方面进行全面审查，并提出处理意见。这是确保处罚决定合法、合理的重要环节。
告知责任：在对当事人作出行政处罚决定前，烟草专卖行政主管部门需要告知当事人拟处罚违法行为的性质及处罚内容，并告知其依法享有的陈述权、申辩权等。这是保障当事人合法权益的重要措施。
决定责任：烟草专卖行政主管部门会作出对当事人的书面行政处罚决定书，明确处罚的种类、依据、履行方式和期限等。
送达责任：处罚决定书作出后，需要由2名以上的行政执法人员及时将处罚决定书送达当事人。送达方式包括直接送达、留置送达、委托送达和邮寄送达等，以确保当事人能够及时收到处罚决定书。
执行责任：当事人需要在收到处罚决定书后15日内到指定的银行缴纳罚款。逾期不缴纳罚款的，将按每日3%加处罚款。如果当事人逾期既不申请复议又不起诉，也不履行处罚决定的，烟草专卖行政主管部门将依法申请人民法院强制执行。
此外，对于持证人而言，如果烟草专卖零售许可证被涂改、伪造或变造，应当及时向原发证机关申请补办，以避免因使用无效证件而受到处罚。同时，持证人也需要加强对自己许可证的保管，防止证件被涂改、损坏或丢失。
综上所述，对使用涂改、伪造、变造的烟草专卖许可证的处罚是一个严格而复杂的程序，需要烟草专卖行政主管部门和持证人共同遵守相关规定和程序。希望以上解答能够对您有所帮助。