公司是否会去查合作方和员工的关系，这并非一个有固定答案的问题，而是取决于多种因素和具体情况。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 公司政策与合规需求：

   • 公司政策：一些公司为了维护内部秩序、防止利益冲突或确保业务合规，可能会制定相关政策，要求员工申报与外部合作方的关系，尤其是当这种关系可能影响到业务决策或利益分配时。
   • 合规需求：在金融、医疗、法律等高度监管的行业，公司可能需要确保员工与外部合作方之间不存在不当关系，以避免违反行业规定或法律法规。

2. 业务合作与利益考量：

   • 业务合作：如果合作方与员工之间存在某种特殊关系（如亲属、朋友、前同事等），且这种关系可能影响到合作的公正性或利益分配，公司可能会出于业务考虑进行调查。
   • 利益冲突：公司可能会担心员工因个人关系而损害公司利益，例如泄露商业秘密、偏袒合作方等，因此可能会进行背景调查或关系核查。

3. 调查方式与限度：

   • 调查方式：公司可能会通过内部调查、员工申报、第三方背景调查等方式来了解合作方与员工的关系。这些方式的选择取决于公司的政策、资源以及调查的紧迫性和重要性。
   • 调查限度：公司在调查过程中应遵守相关法律法规，尊重员工的隐私权和个人信息保护。调查应限于与业务相关的必要范围，避免过度侵入员工的私人生活。

4. 法律后果与风险：

   • 法律后果：如果公司未经员工同意或违反法律法规进行调查，可能会面临法律责任，如侵犯隐私权、违反个人信息保护法等。
   • 风险防控：为了降低法律风险，公司应在制定调查政策时咨询法律专业人士，确保调查方式的合法性和合规性。同时，公司应明确调查的目的和范围，避免不必要的调查行为。

建议：

• 对于员工而言，如果公司要求申报与外部合作方的关系，应如实申报，并了解公司的相关政策和法律法规，以保护自己的合法权益。
• 对于公司而言，在制定和执行相关政策时，应充分考虑法律法规的要求和员工的隐私权保护，确保调查行为的合法性和合规性。

总结来说，公司是否会去查合作方和员工的关系取决于多种因素，包括公司政策、合规需求、业务合作与利益考量等。在调查过程中，公司应遵守相关法律法规，尊重员工的隐私权和个人信息保护。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。