结论：工作单位是高校，在职期间瞒着单位去读港澳博士，是否会被辞退取决于多个因素，包括单位的规章制度、劳动合同的约定以及您的行为是否构成严重违反单位规定等。以下从不同角度进行分析：

1. 单位规章制度与劳动合同的约定：

   • 规章制度：高校作为事业单位，通常会有较为完善的规章制度，其中可能包括关于教职工在职进修、攻读学位等方面的规定。如果规章制度中明确规定了未经批准不得擅自攻读学位，或者攻读学位需满足一定条件并经过单位同意，那么您瞒着单位去读港澳博士的行为可能违反了这些规定。
   • 劳动合同：劳动合同是您与单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中包含了关于在职进修、攻读学位的条款，且您未按照合同约定履行相关义务，那么单位可能依据合同条款对您进行处理，包括辞退。

2. 行为的严重性：

   • 是否构成严重违反单位规定：即使规章制度或劳动合同中有相关规定，但单位在决定是否辞退您时，还会考虑您行为的严重性。如果您的行为并未对单位造成重大损失或影响，且您能够积极改正错误，单位可能会选择给予警告、罚款等较轻的处罚，而不是直接辞退。
   • 是否存在欺诈行为：瞒着单位去读港澳博士，如果单位在招聘或晋升时明确要求了学历或学位条件，且您通过隐瞒真实情况获得了不当利益，那么这种行为可能构成欺诈。在欺诈行为被证实的情况下，单位有权依据相关法律法规和规章制度对您进行处理，包括辞退。

3. 法律后果与建议：

   • 法律后果：如果单位决定辞退您，且辞退决定符合法律法规和规章制度的规定，那么您可能需要接受这一结果。同时，您可能还需要承担因违反规定而产生的其他法律责任，如赔偿单位损失等。
   • 建议：在面临这种情况时，我建议您首先与单位进行沟通，如实说明情况并表达您的意愿和态度。如果单位表示理解并愿意给予您改正的机会，那么您可以积极配合单位的要求，尽快办理相关手续并返回工作岗位。如果单位坚持辞退您，且您认为辞退决定不合法或不合理，那么您可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，维护自己的合法权益。

进一步思考：在决定是否去读港澳博士之前，您应该充分了解单位的规章制度和劳动合同的约定，确保自己的行为符合相关规定。同时，您也可以与单位进行沟通协商，争取获得单位的支持和理解。如果单位同意您攻读学位，那么您可以更加安心地追求自己的学术梦想；如果单位不同意或提出其他要求，那么您需要权衡利弊并做出明智的选择。

最后，如果您在处理此类问题时遇到任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。