对于不动产轮候查封的期限起算时间，确实存在不同的理解和做法。轮候查封登记是指当两个或两个以上法院对同一不动产进行查封时，按照送达时间的先后顺序，在不动产登记部门进行登记。先送达的法院办理查封登记，后送达的法院则依次办理轮候查封登记。当首封依法解除或自动失效后，最先的轮候查封自动转为正式查封。

关于轮候查封期限的起算，主要有两种观点：

1. 一种观点认为，轮候查封期限应从登记机构办理轮候查封登记之时起开始计算。这种观点的支持者认为，这样做可以确保登记簿的记载完整，避免因为起止日期不明确而导致的混乱。同时，也能使法院更准确地把握查封期限，减少因多次查询登记簿而耗费的人力和精力。
2. 另一种观点则认为，轮候查封期限应从首封法院解封或到期失效后，即从轮候查封转为正式查封之时起开始计算。这种观点主要基于轮候查封的实质是顺位等待权，其“转正”时间依赖于首封法院的操作。

然而，现行法律法规及司法解释对轮候查封期限的起算时间并未作出明确规定，导致实践中存在不同的做法。为了统一操作，建议法院在协助执行文书中明确轮候查封期限的起始和终止日期，并要求不动产登记部门在登记簿中载明。这样做既可以确保登记簿的效力，又能使法院和当事人更清晰地了解查封期限，从而维护各方的合法权益。

总的来说，不动产轮候查封期限的起算时间是一个复杂且具有争议的问题。为了解决这个问题，需要相关法律法规的进一步完善和明确，同时也需要法院和不动产登记部门的密切配合和协作。