三方协议的违约金并非一定要交，其支付与否需根据具体情况及协议条款来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、无需支付违约金的情况
协议中未约定违约金条款：
- 如果三方协议中没有明确约定违约金相关内容，或者约定不明确、不合法，那么一方违约时，另一方不能主张违约金。例如，协议中仅笼统提及“违约方需承担责任”，但未具体说明违约金金额或计算方式，此时违约方可能无需支付违约金。
用人单位过错在先：
- 若用人单位存在不诚信或违约行为在先，如未按照协议承诺提供工作岗位、工作条件，或擅自变更薪资待遇等，导致毕业生拒绝履行协议，则毕业生无需支付违约金。在此情况下，用人单位的行为已构成违约，毕业生有权解除协议且不承担违约责任。
不可抗力因素：
- 如毕业生遇到不可抗力事件，如突发重大疾病、自然灾害、战争等，导致其无法履行三方协议，根据法律规定可以部分或全部免除责任，通常无需支付违约金。不可抗力是指不能预见、不能避免且不能克服的客观情况。
违约金显失公平或实际损失小于违约金：
- 若三方协议中约定的违约金数额过高，远远超出了用人单位因毕业生违约所遭受的实际损失，毕业生可以向法院或仲裁机构请求适当减少甚至免除违约金。法院或仲裁机构会根据公平原则和诚实信用原则进行判定。同样，如果违约行为并未给对方造成实际损失，或者造成的损失远小于约定的违约金金额，毕业生也可以请求对违约金进行调整。
二、需支付违约金的情况
协议中明确约定且合法：
- 若三方协议中明确规定了违约金的支付条件和金额，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，一旦毕业生违反协议约定（如明确表示不履行协议、擅自与其他单位签订就业协议等），则应根据《民法典》中关于违约责任的规定，按照协议支付违约金。例如，协议中明确规定“若学生在毕业前擅自解除协议，需向用人单位支付违约金XX元”，则学生违约时需按此金额支付。
专项培训与服务期约定：
- 根据《劳动合同法》，用人单位为劳动者提供专项培训费用并进行专业技术培训的，可与劳动者约定服务期。劳动者违反此约定的，需按约定支付违约金。这是唯一法定允许用人单位与劳动者约定由劳动者承担违约金的情况。如果三方协议中涉及此类约定，且毕业生违反了服务期约定，则需支付相应的违约金。
三、建议与注意事项
- 仔细阅读协议：在签署三方协议前，务必详细阅读并理解所有条款，特别是关于违约金的部分。如有疑问或不合理之处，应及时与用人单位沟通协商，确保自己的权益得到保障。
- 保留证据：在协议履行过程中，妥善保存与用人单位的沟通记录、支付凭证等相关证据，以备不时之需。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。
- 友好协商与法律途径：如遇纠纷且无法与用人单位协商解决，应寻求法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，可以向我咨询以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，三方协议中的违约金支付与否需根据具体情况及协议条款来判断。在签署和履行三方协议时，务必谨慎行事并充分了解相关条款和法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。