民事案件即使超过三年的诉讼时效期间，权利人仍然享有起诉权，但可能面临对方提出的时效抗辩及败诉风险。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效的基本规定
民事案件的普通诉讼时效期间一般为三年，这一规定旨在促使权利人及时行使权利，稳定社会关系。诉讼时效的起算点通常是从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。重要的是，诉讼时效的届满并不意味着权利人实体权利的消灭，而是丧失了通过诉讼程序获得法院对其民事实体权利保护的权利，即胜诉权的丧失。
二、超过诉讼时效起诉的后果
起诉权的保留：
- 即使诉讼时效期间届满，权利人仍然享有提起诉讼的起诉权。人民法院在接到起诉后，若满足法定立案条件，必将依法予以立案，不会仅因诉讼时效问题而拒绝受理。
时效抗辩的风险：
- 被告在接收到起诉通知后，有权选择是否行使诉讼时效抗辩权。若被告提出抗辩且法院审查认为抗辩事由成立，原告可能会面临败诉的风险。这意味着，虽然你可以起诉，但如果对方提出时效抗辩，且法院支持，你的诉讼请求可能不会被支持。
- 相反，若被告未提出诉讼时效抗辩，法院将依据案件的具体事实和证据进行审理和裁判。
法院不主动适用诉讼时效：
- 人民法院不得主动适用诉讼时效的规定来驳回原告的诉讼请求，除非被告明确提出了诉讼时效抗辩。
三、诉讼时效的中止、中断与延长
中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，若因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人没有法定代理人等不能归咎于当事人的原因，导致权利人无法行使请求权，诉讼时效会中止。待中止时效的原因消除后，再满六个月，诉讼时效期间届满。
中断：
- 诉讼时效因权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、提起诉讼或申请仲裁等情形而中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。这有助于保护权利人的合法权益，避免因一时疏忽而错过诉讼时效。
延长：
- 在特殊情况下，如权利人因正当理由未能及时行使权利，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。这为权利人提供了额外的救济途径。
四、实际建议
- 及时行使权利：为了避免诉讼时效问题带来的风险，建议权利人在诉讼时效期间内及时主张自己的权利。
- 收集证据：若因特殊原因超过诉讼时效，仍应积极行使起诉权，并尽可能收集证据以证明存在诉讼时效中止、中断或延长的法定事由。
- 审慎考虑抗辩权：被告在面临超过诉讼时效的起诉时，也应审慎考虑是否行使时效抗辩权，以避免不必要的法律纠纷。
在实际应用中，每个案件的具体情况都有所不同。如果你面临类似问题，或者有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。