核心结论：建设项目停工期间项目经理离职，企业需从合同履行、人员交接、法律责任及后续管理等多方面综合应对，具体措施如下：

1. 审查合同条款，明确权利义务
   首先需核查项目经理的劳动合同、项目管理合同或内部规章制度中关于离职的约定。若合同中明确规定“停工期间项目经理不得擅自离职”或“离职需提前通知并完成交接”，则企业可依据合同要求其承担违约责任（如赔偿损失、支付违约金等）。若合同无特殊约定，则需按《劳动合同法》处理离职程序。

2. 依法办理离职手续，避免程序瑕疵
   根据《劳动合同法》第三十七条，项目经理提前30日书面通知企业即可解除劳动合同（试用期提前3日）。企业应：

   • 要求其提交书面离职申请，明确离职日期；
     
   • 办理工作交接（如项目资料、财务账目、设备清单等），并签署交接确认书；
     
   • 结清工资、加班费、经济补偿（如有）等费用；
     
   • 出具离职证明，并在15日内办理社保、公积金转移手续。
     注意：若项目经理未提前通知或拒不交接，企业可暂缓办理离职手续，但不得扣押工资或证件，否则可能面临行政处罚。

3. 评估项目影响，及时调整管理架构
   停工期间项目经理离职可能影响项目复工进度、质量管控及与业主、监理方的沟通。企业应：

   • 指定临时负责人（如项目副经理、技术负责人）代行职责，确保项目资料完整、现场安全；
     
   • 若原项目经理掌握关键技术或资源，需与其协商签署保密协议或竞业限制协议（需支付补偿）；
     
   • 尽快启动新项目经理招聘或内部调配，避免管理真空。

4. 防范法律风险，保留证据链

   • 保存项目经理离职相关的所有书面文件（如离职申请、交接记录、沟通邮件等）；
     
   • 若其离职导致项目损失（如延误工期、质量事故），需收集证据证明损失与离职的因果关系，以便后续追责；
     
   • 关注其是否违反竞业限制或泄露商业秘密，若发现违法行为可依法维权。

5. 特殊情形处理

   • 若项目经理离职后加入竞争对手：需审查竞业限制协议效力，若协议合法有效且企业已支付补偿，可要求其停止违约行为并赔偿损失；
     
   • 若项目经理拒不交接导致项目停滞：企业可向劳动仲裁机构申请仲裁，要求其履行交接义务或赔偿损失；
     
   • 若停工系因企业原因（如资金链断裂）：项目经理离职可能涉及《劳动合同法》第三十八条“未及时足额支付劳动报酬”等情形，企业需谨慎处理以避免被主张经济补偿。

总结：项目经理离职虽可能给停工项目带来挑战，但企业通过依法合规处理离职程序、及时调整管理架构、完善证据保留，可最大限度降低风险。如有具体纠纷或需进一步指导，可直接向我咨询。