关于公司对员工罚款的合法性问题，这并非一个简单的是非判断，而是需要根据具体情况来详细分析。
一、一般情况下的不合法性
法律依据的缺失：
- 自2008年《企业职工奖惩条例》废止后，我国法律并未再明确赋予用人单位对劳动者进行罚款的权力。因此，在缺乏特别规定的情况下，公司对员工进行罚款通常被视为不合法。
公司规章制度的限制：
- 根据《劳动合同法》，公司在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，必须经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表进行平等协商确定。如果公司未经此民主程序就制定了包含罚款内容的规章制度，那么该规章制度是不合法的，依据其进行的罚款也同样不合法。
- 即便规章制度经过了民主程序，但如果其中的罚款规定违反了法律、法规的强制性规定，比如罚款数额过高，严重影响了员工的基本生活，那么这些规定也是无效的。
二、特殊情况下的合法性
- 赔偿经济损失的情况：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，如果劳动者因本人原因给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。在这种情况下，公司可以从劳动者的工资中扣除赔偿金额，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余的工资不得低于当地的月最低工资标准。
- 需要注意的是，这种扣除工资的行为是基于员工对单位造成的实际损失而承担的赔偿责任，与一般的罚款性质是不同的，并且有明确的扣除比例和底线限制。
三、员工权益的保护
- 如果员工认为公司的罚款行为不合法，首先可以尝试与公司进行协商解决。如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门进行投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结：
公司对员工的罚款行为并非一概而论地合法或不合法，而是需要根据具体情况来判断。在大多数情况下，由于法律未赋予公司罚款的权力，且公司规章制度的制定程序和内容需严格遵守法律规定，因此罚款行为往往被视为不合法。然而，在特定情况下，如员工因个人原因给公司造成经济损失时，公司有权要求员工赔偿损失，并从其工资中合理扣除。员工在面对公司罚款时，应了解自己的合法权益，并采取适当措施进行维权。