结论：犯危害国家安全罪，房子登记在当事人名下，并不直接等同于该房子就完全属于当事人的合法财产，是否属于当事人的合法财产需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
合法财产的认定
- 财产来源合法性：
- 如果房子是通过合法途径取得，比如购买、继承、赠与等，且相关手续完备，那么从形式上看，房子属于当事人所有。但若当事人利用危害国家安全罪所获得的非法收益来购置房产，那么该房产的来源就不合法。根据法律规定，因非法活动所得的财物应当予以追缴或者责令退赔。例如，当事人通过为境外间谍组织提供情报获取报酬，并用这些报酬购买房产，这种情况下房产就可能被认定为非法所得而被追缴。
- 财产与犯罪行为的关联性：
- 若房子与危害国家安全罪的犯罪行为存在直接关联，比如房子被用作犯罪活动的场所，像用于藏匿犯罪工具、进行秘密情报传递等，那么该房产可能会被依法查封、扣押，甚至没收。根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
特殊情况考量
- 家庭共同财产情况：
- 如果房子属于家庭共同财产，而当事人只是其中一部分共有人，且其他共有人对当事人的犯罪行为并不知情，也没有参与。那么在处理该房产时，可能会考虑到其他共有人的合法权益。例如，夫妻共同购买的房产，一方犯危害国家安全罪，另一方并不知情且没有参与犯罪活动，那么在追缴或处理房产时，可能会先分割出另一方的合法份额，只对属于当事人的部分进行处理。
- 善意取得情况：
- 如果当事人将房子转让给第三人，第三人在受让时是善意的，即不知道也不应当知道该房产与犯罪行为有关，并且以合理的价格转让，同时已经办理了相关的产权过户手续，那么第三人可能构成善意取得。在这种情况下，第三人可以依法取得该房产的所有权，而原房产可能就不再作为当事人的财产进行处理。不过，如果第三人明知房产与犯罪行为有关而仍然受让，那么其取得房产的行为就不受法律保护，房产仍可能被追缴。
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