结论：借了五万逾期后协商还款还了一万并取得结清证明，征信并不一定能立即修复，征信的修复需要满足一定条件并经过一定时间。
分析说明：
征信修复的基本条件：
- 征信记录的修复并非简单通过还款和取得结清证明就能实现。征信机构记录的是个人的信用行为，包括贷款的发放、还款情况、逾期记录等。
- 修复征信通常需要满足两个主要条件：一是还清所有逾期款项，二是经过一定的时间周期（通常为五年），在这期间保持良好的信用记录。
结清证明的作用：
- 结清证明是证明你已经还清某笔贷款或债务的文件。它对于向贷款机构或债权人证明你的还款能力是有帮助的，但并不直接等同于征信修复。
- 结清证明可以作为你与贷款机构协商或解决纠纷时的有力证据，但它本身并不具备修复征信的直接效力。
逾期记录对征信的影响：
- 逾期记录是征信记录中的重要负面信息，它会对你的信用评分产生负面影响。
- 即使你后来还清了逾期款项并取得了结清证明，逾期记录仍然会在征信记录中保留一段时间（通常为五年），这期间你的信用评分可能会受到一定影响。
征信修复的具体流程：
- 征信修复并非一个简单的过程，它需要你主动向征信机构提出申请，并提供相关证明材料。
- 征信机构会对你的申请进行审核，并根据审核结果决定是否对你的征信记录进行修复。
- 在修复过程中，你需要保持良好的信用行为，避免再次产生逾期或其他负面信用记录。
特殊场景：
- 如果你在逾期后能够迅速与贷款机构达成协商，并按照协商结果按时还款，且之后保持良好的信用记录，那么你的征信修复过程可能会相对顺利。
- 然而，如果你在逾期后长时间未还款，或者多次逾期，那么即使你后来还清了款项并取得了结清证明，征信修复的难度也会相对较大。
后续行动建议：
- 如果你希望修复征信，首先应该确保所有逾期款项都已经还清，并取得结清证明。
- 其次，你应该主动向征信机构提出修复申请，并提供相关证明材料。
- 在等待征信修复的过程中，你应该保持良好的信用行为，避免再次产生负面信用记录。
- 如果你对征信修复的具体流程或要求有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。