申请人因重大疾病无法书写申请材料时，可通过以下方式完成法律程序，确保申请有效：

1. 委托他人代书并签字确认
   根据《民事诉讼法》第六十一条，当事人可委托近亲属（配偶、父母、子女等）或基层组织（居委会、村委会、单位等）推荐的人员作为代理人。代理人可代为书写申请材料，但需申请人通过按手印、录音录像、公证等方式确认内容真实性。例如，申请人可口头陈述申请意愿，由代理人整理成书面材料后，在公证员见证下按手印确认。

2. 申请法院上门服务或线上办理
   若申请人行动不便，可向法院提交《口头起诉申请书》（可由代理人代写），说明因疾病无法书写的情况，并附医疗证明。法院会根据《民事诉讼法》第八十四条，安排法官上门记录口述内容，或通过在线诉讼平台（如“中国移动微法院”）完成申请流程。部分法院还支持通过视频连线确认申请人身份及意愿。

3. 使用法院提供的格式文本或口头申请
   部分法院为特殊群体提供简化版申请表格，申请人只需口头填写关键信息（如姓名、案由、请求事项），由法院工作人员代为填写后，申请人按手印确认。若完全无法表达，可由监护人或代理人基于申请人此前明确表达的意愿代为申请，但需提供监护关系证明（如户口本、监护协议）。

关键提醒：

• 无论采用哪种方式，均需保留医疗证明（如诊断书、病历）作为证据，证明申请人确实存在书写障碍。
  
• 若涉及重大权益（如大额财产、人身权利），建议同步办理公证或律师见证，增强申请材料的法律效力。
  

如有具体案件细节（如申请类型、疾病类型等），可进一步向我说明，我会结合实务经验提供更精准的建议。