您好，关于社保是否有诉讼时效规定的问题，这是一个涉及法律与实务操作的复杂议题，我来为您详细解答。
首先，需要明确的是，社保补缴并不直接受《民法典》中诉讼时效的限制。社保补缴属于行政征收范畴，其依据的是《社会保险法》等相关行政法规，而非民事法律关系。因此，当涉及到社保补缴时，我们主要关注的是行政追缴的时效性和相关规定。
社保补缴的时效性
行政追缴的时效：
- 根据《劳动保障监察条例》第二十条，虽然一般劳动监察的时效为2年，但社保补缴作为行政征收行为，并不受这一时效的限制。这意味着，即使时间跨度较长，如您提到的2006年至2009年期间公司未缴纳的社保，理论上仍然可以追缴。
司法实践中的处理：
- 在司法实践中，对于多年来的社保欠缴问题，法院往往支持劳动者的补缴请求，并会分别核定、征收社保费用。这体现了法律对劳动者权益的保护，以及对用人单位未依法缴纳社保行为的纠正。
社保补缴的流程与注意事项
收集证据：
- 您需要收集相关证据，如工资单、工作合同、工作证等，以证明您在该公司工作并应有社保缴纳记录。
向社保部门提出申请：
- 向所在地的社保部门提交书面申请，要求补缴社保费用。在申请中，详细说明自己的情况，包括在公司的工作时间、未缴纳社保的情况等。
等待审核与补缴：
- 社保部门会审核您的申请，核实相关证据，确定是否同意追缴。如果同意，您需要按照相关规定缴纳相应的社保费用，同时用人单位也需要补缴其应承担的部分，并可能面临按日加收的滞纳金。
注意地方政策差异：
- 不同地区对于社保补缴的具体流程和手续可能有所不同。例如，某些地区可能要求用人单位主动申请补缴，而个人无法直接办理。因此，在办理手续前，建议您先咨询当地社保部门或相关机构，了解具体的规定和要求。
针对您情况的建议
- 鉴于您提到的时间跨度较长，我建议您尽快收集相关证据，并向当地社保部门提出书面申请，要求补缴社保费用。
- 如果社保部门以超过“时效”为由不予受理，您可以向其说明社保补缴属于行政征收范畴，不受《民法典》诉讼时效的限制，并引用相关法律法规进行据理力争。
- 如果协商不成或遇到其他困难，您还可以考虑通过劳动仲裁或法律途径来维护自己的权益。
总之，社保补缴并不直接受诉讼时效的限制，但具体操作时仍需注意地方政策差异和行政追缴的时效性。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。