网贷逾期协商只还本金是否会影响征信，主要取决于协商结果和后续还款情况。以下从不同角度为您详细分析：
一、协商成功且按新协议还款的情况
不影响征信：
- 如果您与网贷平台协商成功，达成了只还本金的协议，并且按照新的协议按时足额还款，那么通常不会对个人征信产生负面影响。因为这种情况下，您已经与平台就还款事宜达成了一致，属于正常的商业行为，平台不会将逾期记录上报至央行征信系统。
注意事项：
- 协商合法性：必须确保与网贷平台通过官方渠道达成书面协议，口头承诺不具备法律效力。
- 还款完整性：必须全额履行协议约定的本金金额，任何欠款都可能触发新的违约记录。
- 信息更新时效：多数机构每月向征信中心报送数据，延迟更新可能导致短期显示逾期状态，但只要您按时还款，最终不会影响征信。
二、协商未成功或未按新协议还款的情况
影响征信：
- 逾期记录上报：如果协商不成功，或者虽然协商成功但未能按照新的协议按时还款，导致贷款逾期，那么网贷平台有权将逾期记录上报至央行征信系统。一旦逾期记录被记录在案，将对个人信用造成不良影响。
- 征信受损后果：征信受损后，您在未来申请信用卡、贷款等金融服务时可能会受到限制，甚至被拒绝。此外，逾期记录还可能影响您的职业发展和生活品质，如无法享受一些需要良好信用记录的优惠政策或服务。
特殊情况：
- 部分非正规平台：可能未接入央行征信系统，但存在暴力催收风险。即使达成协议，若平台违规操作或数据未及时更新，仍可能导致征信异常。因此，建议选择持牌机构进行协商。
- 减免利息作为特殊交易标记：部分金融机构可能将“减免利息”作为特殊交易标记，虽不直接扣分，但可能影响未来信贷评估。
三、潜在风险提示
二次违约后果：
- 如果您未按约定时间偿还本金，不仅恢复计算罚息，更会加重征信污点。这将对您的信用记录造成更严重的损害，影响您未来的金融活动。
机会成本损失：
- 选择只还本金可能放弃利息减免外的其他优惠（如分期手续费减免），您需要综合评估经济得失，确保这一选择符合您的长期利益。
特殊条款约束：
- 部分协议可能要求一次性清偿本金，若您资金不足导致再次逾期，将面临更严厉的风控措施，如更高的罚息、更严格的催收等。
四、建议与应对措施
- 确保协商合法性：与网贷平台协商时，务必通过官方渠道达成书面协议，并保留好相关证据。
- 按时足额还款：按照新协议按时足额还款，避免产生新的逾期记录。
- 关注征信更新：定期查询个人征信报告，确保信息准确无误。如发现异常，及时与网贷平台和征信机构沟通解决。
- 谨慎选择协商对象：优先选择持牌机构进行协商，避免与非正规平台打交道，以降低风险。
总结来说，网贷逾期协商只还本金是否会影响征信，关键在于协商结果和后续还款情况。如果您能够成功协商并按时还款，通常不会影响征信；但如果协商失败或未按协议还款，则可能对征信造成不良影响。因此，在协商过程中，您需要谨慎对待每一个环节，确保自己的权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。