结论：保险一年内修两次车，两次维修金额超保额时，保险公司是否赔偿需分情况讨论，具体如下：

1. 若保险合同为“损失补偿型”且未约定累计赔偿限额
   在财产保险（如车损险）中，保险合同通常遵循“损失补偿原则”，即保险公司赔偿金额以被保险人实际损失为限，且不超过保险金额（保额）。若两次维修均属于保险责任范围（如因意外事故导致），且每次损失单独计算均未超保额，但累计金额超过保额的，保险公司通常仅按保额上限赔偿，超出部分需车主自行承担。
   例如：保额为5万元，第一次维修3万元，第二次维修3万元，累计6万元，保险公司最多赔偿5万元。

2. 若保险合同明确约定“累计赔偿限额”
   部分保险产品会在合同中约定“累计赔偿限额”（即保险期间内所有赔偿的总和上限），若两次维修累计金额超过该限额，则保险公司仅按累计限额赔偿，超出部分不赔。
   例如：合同约定累计赔偿限额为4万元，即使保额为5万元，两次维修累计6万元，保险公司也仅赔偿4万元。

3. 若第二次维修属于“重复修理”或“扩大损失”
   若第二次维修是由于第一次维修未彻底修复、车主未妥善保管车辆导致损失扩大，或维修项目与事故无关（如车主自行改装导致损坏），保险公司可能对第二次维修费用拒赔，此时累计赔偿金额可能仅包含第一次合理维修费用。

4. 若保险合同为“定额给付型”或特殊约定
   少数保险产品（如某些附加险）可能采用“定额给付”方式，即按合同约定金额赔偿，与实际损失无关。但车损险通常不属于此类，需以合同条款为准。

建议：

• 立即查阅保险合同中的“保险责任”“赔偿限额”“责任免除”等条款，确认是否涉及累计赔偿限制或特殊约定；
  
• 若对条款理解不清，可提供合同具体内容，我将进一步分析；
  
• 若保险公司拒赔或赔偿金额存疑，可依据合同条款与保险公司协商，或通过法律途径解决。
  

如有其他疑问，欢迎直接向我咨询。