习惯航道是否需要申请海域使用权需分情况讨论，具体如下：

1. 若习惯航道位于我国内水或领海范围内
   根据《中华人民共和国海域使用管理法》第二条，海域使用权的适用范围包括内水、领海及专属经济区中属于我国管辖的部分。若习惯航道位于上述区域，且涉及对海域的持续性、排他性使用（如长期固定航线、占用特定海域空间等），则需依法申请海域使用权。例如：
   

• 港口航道：因涉及港口建设、航道疏浚等工程，需通过海域使用权审批明确使用权范围及期限；
  
• 养殖航道：若航道与养殖区域重叠，需通过海域使用权划分权属边界，避免纠纷。
  

1. 若习惯航道位于公海或专属经济区中非我国管辖部分
   根据《联合国海洋法公约》，公海及他国专属经济区不受我国海域使用权制度约束。此时，航道使用无需申请我国海域使用权，但需遵守国际法规则（如无害通过权、航行自由原则等）。例如：
   

• 国际航运航线：船舶在公海或他国专属经济区航行时，仅需遵守国际航行规则，无需申请我国海域使用权；
  
• 科研考察航道：若涉及他国管辖海域，需通过外交途径或国际合作协议明确权利义务。
  

1. 特殊情形：临时性、非排他性使用
   若航道使用具有临时性（如短期科考、应急救援）或非排他性（如多艘船舶共享航道且不占用特定海域空间），可能无需单独申请海域使用权，但需符合以下条件：
   

• 不损害其他海域使用权人的合法权益；
  
• 不违反海洋功能区划或生态保护要求；
  
• 依法报备或取得临时使用许可（如海事部门航行通告）。
  

建议：若您涉及具体航道使用项目，需结合航道地理位置、使用性质及当地海洋功能区划综合判断。如有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案例为您分析。