工程车挂靠未结束时进行转让，这一行为是否违法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
一、挂靠协议的约定
若挂靠协议中明确禁止转让：
- 在挂靠协议有效期内，若双方明确约定了禁止转让工程车或挂靠关系的条款，那么未经对方同意擅自转让，将构成违约行为。根据《民法典》的相关规定，违约方需承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。
若挂靠协议未明确禁止转让：
- 若挂靠协议中未明确禁止转让，或者虽未明确但根据协议性质、目的和交易习惯可以推断出允许转让的，那么转让行为本身可能不构成违约。但即便如此，转让方仍需确保转让行为符合相关法律法规的规定，并履行必要的通知、协商等义务。
二、法律法规的遵守
车辆转让的法律规定：
- 根据《机动车登记规定》，车辆所有权发生转移的，应当办理转移登记。因此，在工程车挂靠未结束时进行转让，必须确保车辆所有权转移手续合法合规，包括签订转让合同、办理车辆过户登记等。
挂靠关系的法律性质：
- 挂靠关系通常涉及挂靠方和被挂靠方之间的权利义务关系。在转让工程车时，需明确挂靠关系是否随车辆所有权一并转移。若挂靠关系不随车辆所有权转移，则转让方需与被挂靠方协商解除挂靠关系，或确保受让方与被挂靠方重新建立挂靠关系。
行政许可和资质要求：
- 若工程车从事的是需要特定行政许可或资质的经营活动（如道路运输），则转让方需确保受让方具备相应的行政许可或资质。否则，转让行为可能因违反相关法律法规而无效或受到行政处罚。
三、实际操作中的注意事项
协商一致：
- 在转让工程车前，建议转让方与被挂靠方、受让方进行充分协商，明确各自的权利义务和转让条件。这有助于避免后续纠纷和法律风险。
完善手续：
- 转让方需确保车辆所有权转移手续、挂靠关系变更手续等合法合规。必要时，可寻求专业律师或相关机构的帮助，以确保手续的完善性和合法性。
风险评估：
- 在转让前，转让方应对受让方的资信状况、经营能力等进行评估，以降低转让后的风险。同时，也可考虑在转让合同中设置相应的风险防控条款。
总结与建议：工程车挂靠未结束时进行转让，是否违法需根据挂靠协议的约定、法律法规的遵守以及实际操作中的注意事项来综合判断。为确保转让行为的合法性和有效性，建议转让方在转让前充分了解相关法律法规和协议约定，与相关方进行充分协商，并完善相关手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。