在交通事故中，若对方负主要责任，您方负次要责任，且您方车损为五千元，赔偿问题可以这样分析：

1. 责任比例与赔偿原则：

   • 根据交通事故责任认定，对方负主要责任，意味着对方应承担大部分赔偿责任；您方负次要责任，则需承担较小部分的赔偿责任。
   • 赔偿原则通常遵循“按责赔偿”，即根据双方的责任比例来分担损失。

2. 赔偿计算方式：

   • 假设主要责任与次要责任的比例为70%和30%（这一比例可能因地区或具体案情有所不同，但此处为示例说明），则对方应承担您方车损的70%，您方自行承担30%。
   • 具体计算公式：对方赔偿金额 = 您方车损金额 × 对方责任比例 = 5000元 × 70% = 3500元；您方自行承担金额 = 您方车损金额 × 您方责任比例 = 5000元 × 30% = 1500元。

3. 实际赔偿流程：

   • 在实际操作中，双方应首先通过协商来确定赔偿金额和方式。如果协商不成，可以寻求交警部门的调解或通过法律途径解决。
   • 如果对方有保险，且保险覆盖此次事故的损失，那么对方保险公司将按照责任比例来赔偿您方的损失。
   • 您方也需要向自己的保险公司报案，但根据责任比例，您方保险公司可能不会直接赔偿您方的全部损失，而是根据您方的责任比例来扣除相应部分。

4. 特殊情况考虑：

   • 如果对方没有保险或保险不足，那么对方可能需要个人承担赔偿责任。如果对方无力赔偿，您方可能需要通过法律途径来追讨赔偿。
   • 如果您方对责任认定有异议，可以在收到责任认定书后的一定期限内向上级交警部门申请复核。

总结与建议：

• 在此次事故中，根据假设的责任比例，您方应获得3500元的赔偿，自行承担1500元的损失。
• 建议您首先与对方进行协商，尝试达成赔偿协议。如果协商不成，可以寻求交警部门的调解或咨询专业律师，通过法律途径来维护自己的权益。
• 在处理此类事故时，务必保留好相关证据，如事故现场照片、责任认定书、维修发票等，以便在需要时提供证明。

如果您有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更全面的帮助。