针对员工非法转租公司厂房并私分应付房租的情况，房租的计算及法律责任需从以下几个角度分析：
一、非法转租的法律定性及房租计算基础
非法转租的无效性
根据《民法典》第七百一十六条，承租人未经出租人同意转租的，出租人有权解除合同。若公司（作为出租人）未授权员工转租厂房，则转租行为无效，公司有权要求实际使用人（次承租人）腾退房屋，并直接向公司支付租金或使用费。
房租计算的依据
- 原合同租金标准：若公司与员工签订的租赁合同中明确约定了租金金额，公司可依据该标准向实际使用人主张租金。
- 市场价评估：若原合同租金明显低于市场价，公司可委托评估机构对厂房市场租金进行评估，并按评估价主张权利。
- 实际损失赔偿：若因转租导致公司遭受其他损失（如房屋损坏、空置期损失等），公司可要求员工赔偿实际损失。
二、员工私分房租的法律责任
民事责任
- 返还财产：员工私分的房租属于公司财产，公司有权要求员工全额返还。
- 赔偿损失：若私分行为导致公司损失（如未足额收取租金、维权成本等），员工需承担赔偿责任。
- 合同违约责任：若员工行为违反租赁合同约定（如擅自转租条款），公司可依据合同要求员工支付违约金。
刑事责任（若构成犯罪）
- 职务侵占罪：若员工利用职务便利，将公司财物（房租）非法占为己有，数额较大的，可能构成职务侵占罪（《刑法》第二百七十一条）。
- 立案标准：根据最新司法解释，职务侵占罪的立案标准为数额在3万元以上。
- 量刑：数额较大的，处三年以下有期徒刑或拘役；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑。
- 贪污罪（若员工具有国家工作人员身份）：若员工属于国家工作人员（如国有企业员工），利用职务便利侵占公共财物，可能构成贪污罪，量刑更重。
三、公司维权的具体步骤
收集证据
- 租赁合同、转租协议（如有）、房租支付记录、员工私分房租的证据（如转账记录、聊天记录等）。
- 实际使用人（次承租人）的占用证明（如水电费缴纳记录、物业证明等）。
协商或发函
- 向员工及实际使用人发函，要求停止转租、腾退房屋并支付租金。
- 明确要求员工返还私分房租及赔偿损失。
诉讼或仲裁
- 若协商无果，公司可向法院提起民事诉讼，要求员工返还财产、赔偿损失，并要求实际使用人支付租金或使用费。
- 若涉及刑事犯罪，公司可向公安机关报案，追究员工刑事责任。
四、特殊情形处理
公司知情或默许转租
若公司明知员工转租但未明确反对，可能被视为默许转租。此时，公司仍可主张租金，但员工私分房租的行为可能仅构成民事违约，而非刑事犯罪。
实际使用人善意取得
若实际使用人不知转租未经同意且已支付合理租金，公司可能无法直接要求其腾退，但可要求员工承担违约责任。
总结：员工非法转租公司厂房并私分房租的，公司有权要求员工返还全部房租、赔偿损失，并依据合同或市场价向实际使用人主张租金。若员工行为构成职务侵占罪或贪污罪，公司可报案追究其刑事责任。建议公司尽快收集证据，通过协商或法律途径维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。