在行政诉讼中，行政部门若想要赢得诉讼，需要从多个方面进行综合考量和精准把控。以下是一些关键步骤和策略，希望能为您提供清晰、详细且有深度的指导。

一、确保起诉未超期

首先，要密切关注行政诉讼的起诉期限。一般直接起诉的期限为自知道或应当知道行政行为之日起六个月内；若经过复议程序，则起诉期限为收到复议决定书之日起十五日内。务必确保在法定期限内提起诉讼，否则法院将驳回起诉，这将是行政部门赢得诉讼的首要前提。

二、确定适格被告

准确认定被告是行政诉讼中的关键一步。需要根据作出具体行政行为的主体、行政职权的行使情况等因素来确定适格被告。如果被告不适格，比如只起诉了联合作出行政行为中的一个部门，而该部门并非主要责任方，那么法院可能会驳回起诉。因此，行政部门应深入研究行政行为的作出主体和授权关系，确保被告适格。

三、准备充分确凿的证据

在行政诉讼中，证据是决定胜负的关键因素。行政部门需要准备充分、确凿的证据来证明自己的行政行为合法、合理。这包括书证（如行政决定书、通知书等）、物证（如涉及物品处理的案件中的相关物品或照片）、证人证言、视听资料（如录音、录像等，但需合法获取）以及电子数据等。同时，行政部门也要仔细审查对方提供的证据，找出其瑕疵、漏洞或违法之处，以削弱对方证据的证明力。

四、精准提出诉讼请求

诉讼请求应明确具体，与案件事实和法律规定紧密相关。行政部门在提出诉讼请求时，应明确指出要求法院撤销或变更的具体行政行为，以及该行政行为违法的具体情形。如果涉及行政赔偿，要明确赔偿范围、数额及计算依据。模糊不清或不合理的诉讼请求难以得到法院的支持。

五、准确适用法律

行政部门需要熟悉相关法律领域的规定，准确指出自己行政行为在法律适用方面的正确性。同时，也要了解并准确引用相关法律法规、规章及规范性文件，以证明自己的行政行为符合法律规定。如果对方指出行政行为在法律适用方面存在错误，行政部门应能够迅速、准确地进行反驳。

六、充分利用程序权利

行政部门应充分了解并积极利用行政诉讼的法定程序权利，如立案、审理、证据交换、庭审等。在诉讼过程中，要遵守法定程序，按时提交证据、参加庭审，有效陈述事实、发表辩论意见，并对对方观点和证据进行质证。通过充分利用程序权利，行政部门可以更好地展示自己的立场和证据，增加赢得诉讼的机会。

七、考虑行政机关态度及配合程度

行政机关在诉讼过程中的配合程度也可能影响胜诉几率。如果行政部门能够积极应诉，认可部分或全部错误（如果确实存在），并表现出改正的诚意和行动，这将有助于赢得法院的信任和支持。同时，行政部门也应尊重法院的判决结果，如果判决不利，应考虑通过合法途径进行申诉或上诉，而不是采取不配合或抵触的态度。

八、寻求专业法律帮助

如果行政部门对法律程序不熟悉或案件较为复杂，可以考虑聘请专业的行政诉讼律师。律师具有丰富的法律知识和实践经验，能够为行政部门提供专业的法律建议和指导，帮助行政部门更好地准备诉讼材料、应对庭审挑战，并增加赢得诉讼的几率。

综上所述，行政部门在行政诉讼中赢得诉讼需要综合考虑多个方面，包括确保起诉未超期、确定适格被告、准备充分确凿的证据、精准提出诉讼请求、准确适用法律、充分利用程序权利、考虑行政机关态度及配合程度以及寻求专业法律帮助等。通过做好这些方面的准备和把控，行政部门可以大大提高赢得诉讼的几率。