合同中约定分两次付款，每次支付50%的款项，可以按照以下方式撰写条款：

1. 明确付款阶段与比例：

   • 在合同中明确约定付款分为两个阶段，每个阶段支付合同总金额的50%。例如：“本合同项下的款项支付方式为分期支付，具体为：合同签订后[具体日期或条件，如“五个工作日内”]支付合同总金额的50%，即人民币[具体金额]元；剩余50%款项，即人民币[具体金额]元，在[具体日期或条件，如“项目完成并验收合格后五个工作日内”]支付。”

2. 设定付款条件与时间节点：

   • 除了明确付款比例，还应设定具体的付款条件和时间节点。这有助于确保双方对付款时间有明确的预期，减少纠纷。如上述示例中，就明确指出了第一次付款是在合同签订后五个工作日内，第二次付款是在项目完成并验收合格后五个工作日内。

3. 规定违约责任：

   • 在合同中应明确规定，如果一方未能按照约定的时间和比例支付款项，应承担的违约责任。这可以包括支付违约金、赔偿损失等。例如：“若乙方（付款方）未按照本合同约定的时间和比例支付款项，应自逾期之日起，每日按未支付金额的[具体比例，如“0.05%”]向甲方（收款方）支付违约金，并赔偿甲方因此遭受的全部损失。”

4. 考虑其他相关条款：

   • 根据合同的具体性质和双方的需求，还可以考虑加入其他相关条款，如付款方式（银行转账、支票等）、发票开具、付款确认等。这些条款有助于确保付款流程的顺畅和双方权益的保障。

示例条款：

“本合同项下的款项支付方式为分期支付，具体为：

1. 合同签订后五个工作日内，乙方应向甲方支付合同总金额的50%，即人民币[具体金额]元；
2. 项目完成并验收合格后五个工作日内，乙方应向甲方支付剩余50%款项，即人民币[具体金额]元。

若乙方未按照本合同约定的时间和比例支付款项，应自逾期之日起，每日按未支付金额的0.05%向甲方支付违约金，并赔偿甲方因此遭受的全部损失。

双方同意，付款方式为银行转账，甲方应在收到款项后三个工作日内向乙方开具相应金额的发票。乙方支付款项后，有权要求甲方出具付款确认书。”

在撰写合同时，请务必根据实际情况和双方的具体需求进行调整和完善。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。